甲基接受

doi:10.18129/b9.bioc.methylcc

这是发展甲基接受的版本;对于稳定版本,请参阅甲基接受

估计DNA甲基化样品中全血细胞组成

生物导体版本:开发(3.16)

一种估计在任何平台技术(微阵列和测序)上测量的DNA甲基化全血样品的细胞组成的工具。

作者:Stephanie C. Hicks [AUT,CRE],Rafael Irizarry [AUT]

维护者:Stephanie C. Hicks

引用(从r内,输入引用(“甲基接受”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ methylcc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“甲基接受”)

html R脚本 MEDYLCC用户指南
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件,,,,全媒体
版本 1.11.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年)
执照 CC由4.0
要看 r(> = 3.6),Flowsorted.blood.450k
进口 生物酶,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,Minfi,,,,BSSEQ,,,,Quadprog,,,,plyranges,统计,utils,Bumphunter,,,,GeneFilter,方法,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19
链接
建议 rmarkDown,,,,尼特,,,,测试(> = 2.1.0),生物基因,,,,生物使用,,,,花花公子,,,,GGPLOT2
系统要求
增强
URL https://github.com/stephaniehicks/methylcc/
BugReports https://github.com/stephaniehicks/methylcc/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 METHYLCC_1.11.0.TAR.GZ
Windows二进制 METHILCC_1.11.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) 甲基接受者1.11.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylcc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/甲基接受
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/methylcc/
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