这是发展甲基接受的版本;对于稳定版本,请参阅甲基接受。
生物导体版本:开发(3.16)
一种估计在任何平台技术(微阵列和测序)上测量的DNA甲基化全血样品的细胞组成的工具。
作者:Stephanie C. Hicks [AUT,CRE],Rafael Irizarry [AUT]
维护者:Stephanie C. Hicks
引用(从r内,输入引用(“甲基接受”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ methylcc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“甲基接受”)
html | R脚本 | MEDYLCC用户指南 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DNAMETHYLATY,,,,甲基,,,,甲基化array,,,,微阵列,,,,测序,,,,软件,,,,全媒体 |
版本 | 1.11.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(2。5年) |
执照 | CC由4.0 |
要看 | r(> = 3.6),Flowsorted.blood.450k |
进口 | 生物酶,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,Minfi,,,,BSSEQ,,,,Quadprog,,,,plyranges,统计,utils,Bumphunter,,,,GeneFilter,方法,Illuminahumanmethylation450Kmanifest,Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19 |
链接 | |
建议 | rmarkDown,,,,尼特,,,,测试(> = 2.1.0),生物基因,,,,生物使用,,,,花花公子,,,,GGPLOT2 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/stephaniehicks/methylcc/ |
BugReports | https://github.com/stephaniehicks/methylcc/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | METHYLCC_1.11.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | METHILCC_1.11.0.ZIP |
MacOS 10.13(高山脉) | 甲基接受者1.11.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylcc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/甲基接受 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/methylcc/ |
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