甲基

doi：10.18129/b9.bioc.methylgsa

这是发展甲基甲基的版本；对于稳定版本，请参阅甲基。

使用差分甲基的结果进行基因集分析

生物导体版本：开发（3.16）

甲基甲基的主要功能是甲基glm和甲基拉。甲基分子实现逻辑回归，以调整探针的数量为协变量。甲基拉通过稳健的秩聚集来调整每个基因的多个p值。有关更多详细的帮助信息，请参阅小插图。

作者：Xu Ren [AUT，CRE]，PEI FEN KUAN [AUT]

维护者：Xu Ren

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ edimylgsa”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“甲基分子”）

html	R脚本	甲基甲基：DNA甲基化数据集的基因集分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，结肠管制，，，，基因烯，，，，途径，，，，回归，，，，软件
版本	1.15.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL-2
要看	R（> = 3.5）
进口	Robustrankaggreg，，，，GGPLOT2，，，，Stringr，统计clusterProfiler，，，，甲基小姐，org.hs.eg.db，reactome.db，生物比较，go.db，AnnotationDbi，，，，闪亮的，Illuminahumanmethylation450Kanno.ILMN12.HG19，Illuminahumanmethylationepicanno.ilm10b4.hg19
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，富集
系统要求
增强
URL	https://github.com/reese3928/methylgsa
BugReports	https://github.com/reese3928/methylgsa/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	METHYLGSA_1.15.0.TAR.GZ
Windows二进制	甲基gs_1.15.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	甲基gs_1.15.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylgsa
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/methylgsa/
软件包下载报告	下载统计