甲基锁

doi：10.18129/b9.bioc.methylclock

这是发展甲基锁的版本；对于稳定版本，请参阅甲基锁。

甲基锁 - 基于DNA甲基化的时钟

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包允许使用不同的甲基化时钟估算年代和妊娠DNA甲基化（DNAM）年龄以及生物年龄。年代dnam年龄（年）：Horvath的时钟，Hannum的时钟，BNN，Horvath的皮肤+血钟，Pedbe Clock和Wu的时钟。妊娠dnam时代：骑士时钟，博林的时钟，梅恩的时钟和李的时钟。生物DNAM时钟：莱文的时钟和端粒长度的时钟。

作者：Dolors Pelegri-Siso [AUT，CRE]，胡安·冈萨雷斯[aut]

维护者：dolors belegri-siso

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“甲基克洛克”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“甲基锁”）

html	R脚本	使用不同的甲基化时钟DNAM AGE
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	生物问题，，，，DNAMETHYLATY，，，，正常化，，，，预处理，，，，软件，，，，统计信息
版本	1.3.1
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（1年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 4.1.0），甲基clockdata，，，，DevTools，，，，Quadprog
进口	RCPP（> = 1.0.6），实验室，，，，dplyr，，，，算，，，，表演，，，，生物酶，，，，GGPMISC，，，，平淡无奇，，，，GGPLOT2，，，，ggpubr，，，，Minfi，，，，蒂布尔，，，，rpmm，统计，图形，花花公子，，，，栅格，，，，预处理，，，，DynamiCtreCut，，，，行星
链接	RCPP
建议	生物使用，，，，尼特，，，，地球，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/isglobal-brge/methylclock
BugReports	https://github.com/isglobal-brge/methylclock/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	甲基克洛克_1.3.1.tar.gz
Windows二进制	甲基克洛克_1.3.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	甲基克洛克_1.3.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylclock
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/甲基克洛克
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/methylclock/
软件包下载报告	下载统计