mgsa

DOI:10.18129 / B9.bioc.mgsa

这是发展mgsa版本;稳定版请参见mgsa．

基于模型的基因集分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

基于模型的基因集分析(MGSA)是一种用于基因集富集的贝叶斯建模方法。包mgsa与基因本体一起实现mgsa和使用mgsa的工具。

作者:Sebastian Bauer ， Julien Gagneur < Gagneur at genzentrum.lmu.de>

维护者:Sebastian Bauer <邮件在sebastianbauer.info>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("mgsa")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“mgsa”)

PDF	R脚本	mgsa包概述。
PDF		参考手册

细节

biocViews	去，GeneSetEnrichment，通路，软件
版本	1.45.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(11.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.14.0)，方法，gplots
进口	图形，统计，效用
链接
建议	DBI，RSQLite，GO.db，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sba1/mgsa-bioc
全靠我
进口我
建议我	pareg
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	mgsa_1.45.0.tar.gz
Windows二进制	mgsa_1.45.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	mgsa_1.45.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mgsa
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mgsa
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mgsa/
软件包下载报告	下载数据