这是发展miRLAB版本;稳定发布版本请参见miRLAB.
Bioconductor版本:开发(3.16)
提供工具探索miRNA- mrna的关系,包括流行的miRNA靶预测方法,集成方法,整合个别方法,功能从在线资源获取数据,功能验证结果,和功能进行富集分析。
作者:Thuc Duy Le,张俊鹏,陈默,范越煌
维护人员:Thuc Duy Le
引用(从R中,输入引用(“miRLAB”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("miRLAB")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“miRLAB”)
超文本标记语言 | R脚本 | miRLAB |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,网络,NetworkInference,软件,microrna的 |
版本 | 1.27.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.2 (R-3.2)(6.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | 方法、统计跑龙套,RCurl,httr,stringr,Hmisc,能源,熵,gplots,glmnet,嫁祸于,limma,pcalg,TCGAbiolinks,dplyr,SummarizedExperiment,ctc,InvariantCausalPrediction,类别,GOstats,org.Hs.eg.db |
链接 | |
建议 | knitr,BiocGenerics,AnnotationDbi,RUnit,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pvvhoang/miRLAB |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | miRLAB_1.27.0.tar.gz |
Windows二进制 | miRLAB_1.27.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | miRLAB_1.27.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRLAB |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRLAB |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/miRLAB/ |
包下载报告 | 下载数据 |
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Bioconductor
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