这是发展MIA的版本;对于稳定版本,请参阅米娅。
生物导体版本:开发(3.16)
MIA基于总结性特征,单链体和树木芒术经验基础设施来实现微生物组分析的工具。在分类数据的背景下,数据争吵和分析是主要范围。实施了共同任务的其他功能,例如社区指数计算和汇总。
作者:Felix G.M.恩斯特[aut,cre],Sudarshan A. Shetty [aut],Tuomas Borman [AUT],Leo Lahti [aut],Yang Cao [CTB],Nathan D. Olson [CTB],Levi Waldron [CTB],Marcel Ramos [CTB],HéctorCorrada Bravo [CTB],Jayaram Kancherla [CTB],Domenick Braccia [CTB] [CTB] [CTB] [CTB]
维护者:Felix G.M.ernst
引用(从r内,输入引用(“ MIA”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ mia”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Mia”)
html | R脚本 | 米娅 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | DataImport,,,,微生物组,,,,软件 |
版本 | 1.5.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.13(R-4.1)(1年) |
执照 | Artistic-2.0 |文件执照 |
要看 | r(> = 4.0),总结性特征,,,,Singlecellexperiment,,,,树木化的特殊性(> = 1.99.3),多亚sayExexperiment |
进口 | 方法,统计,utils,大量的,,,,猿,,,,Decontam,,,,素食主义者,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,生物弦,,,,解码,,,,生物比较,,,,延迟,,,,延迟的matrixstats,,,,砍伐,,,,评分,,,,dirichletmultinomial,,,,rlang,,,,dplyr,,,,蒂布尔,,,,花花公子 |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,拼布,,,,生物使用,,,,Yaml,,,,门索,,,,Dada2,,,,Stringr,,,,生物形式,,,,枯萎病,,,,ADE4,,,,微生物膜,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/microbiome/mia |
BugReports | https://github.com/microbiome/mia/issues |
取决于我 | 迈维兹 |
进口我 | 策划的元素元素 |
建议我 | CBEA,,,,菲尔 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mia_1.5.0.tar.gz |
Windows二进制 | mia_1.5.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | mia_1.5.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mia |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/MIA |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/mia/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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