微生物组

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiome

这是发展版本的微生物;稳定发布版本请参见微生物组．

微生物分析

Bioconductor版本:开发(3.16)

微生物组分析的实用程序。

作者:Leo Lahti， Sudarshan Shetty [au]

维护者:Leo Lahti < Leo。拉赫蒂在iki.fi >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("microbiome")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(微生物)

超文本标记语言	R脚本	微生物R包
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	宏基因组，微生物组，测序，软件，SystemsBiology
版本	1.19.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证	BSD_2_clause +文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0),phyloseq，ggplot2
进口	Biostrings，作文，dplyr，reshape2，Rtsne，尺度统计数据,宠物猫，tidyr跑龙套,素食主义者
链接
建议	BiocGenerics，BiocStyle，开罗，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://microbiome.github.io/microbiome
BugReports	https://github.com/microbiome/microbiome/issues
取决于我
进口我	ANCOMBC
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	microbiome_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	microbiome_1.19.0.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiome
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/微生物
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/microbiome/
包下载报告	下载数据