马赛克

DOI:10.18129 / B9.bioc.mosaics

这是发展马赛克的版本;稳定的发布版本,请参阅马赛克。

马赛克(基于模型的一个和两个样品分析和推理ChIP-Seq)

Bioconductor版本:发展(3.16)

这个包提供了函数拟合马赛克和MOSAiCS-HMM,统计框架来分析一个样品或两个示例ChIP-seq转录因子的数据绑定和组蛋白修饰。

作者:东峻涌裴分矿,Rene韦尔奇,Sunduz凯尔

维护人员:东峻涌<东峻。钟在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“马赛克”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“马赛克”)

PDF	R脚本	马赛克
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,ChIPseq,遗传学,测序,软件,转录
版本	2.35.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.0.0)、方法、图形、Rcpp
进口	质量样条函数,晶格,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,GenomeInfoDb,S4Vectors
链接	Rcpp
建议	mosaicsExample
SystemRequirements	Perl
增强了	平行
URL	http://groups.google.com/group/mosaics_user_group
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	mosaics_2.35.0.tar.gz
Windows二进制	mosaics_2.35.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	mosaics_2.35.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosaics
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/马赛克
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/mosaics/
包下载报告	下载数据