菲尔

doi：10.18129/b9.bioc.philr

这是发展Philr的版本；对于稳定版本，请参阅菲尔。

基于系统发育分区的ILR转换宏基因组学数据

生物导体版本：开发（3.16）

Philr对于系统发育等距记录比率变换而言是缩写。该软件包提供了用于分析组成数据的功能（例如，代表不同变量/零件比例的数据）。具体而言，该软件包允许分析组合数据，其中零件可以通过系统发育树（在微生物群调查数据中很常见）相关，并使从系统发育树构建的等距对数比率转换可用，并利用加权参考度量。

作者：贾斯汀·西尔弗曼（Justin Silverman）[AUT，CRE]，Leo Lahti [CTB]

维护者：贾斯汀·西尔弗曼（Justin Silverman）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ philr”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Philr”）

html	R脚本	菲尔简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	免疫学，，，，宏基因组学，，，，微生物组，，，，测序，，，，软件
版本	1.23.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	GPL-3
要看
进口	猿，，，，Phangorn，，，，花花公子，，，，GGPLOT2，，，，格特里， 方法
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，生态学家，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，门索，，，，总结性特征，，，，树木化的特殊性，，，，Glmnet，，，，dplyr，，，，米娅
系统要求
增强
URL	https://github.com/jsilve24/philr
BugReports	https://github.com/jsilve24/philr/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	philr_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	philr_1.23.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Philr_1.23.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/philr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/philr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/philr/
软件包下载报告	下载统计