R3CSEQ

doi：10.18129/b9.bioc.r3cseq

这是发展R3CSEQ的版本;对于稳定版本，请参阅R3CSEQ。

染色体构象捕获和下一代测序的分析（3C-Seq）

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包用于分析来自3C-Seq分析的远程染色质相互作用。

作者：Supat Thongjuea，MRC WIMM计算生物学中心，英国牛津大学韦瑟尔分子医学研究所

维护者：supat thongjuea 或

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ r3cseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ r3cseq”）

PDF	R脚本	R3CSEQ
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	预处理，，，，测序，，，，软件
版本	1.43.0
在生物导体中	Bioc 2.9（R-2.14）（10。5年）
执照	GPL-3
要看	基因组机，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，VGAM，，，，QVALUE
进口	方法，GenomeInfodB，，，，iranges，，，，生物弦，，，，Data.Table，，，，SQLDF，，，，rcolorbrewer
链接
建议	bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9.masked，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18.masked，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked，，，，bsgenome.rnorvegicus.ucsc.rn5.masked
系统要求
增强
URL	http://r3cseq.genereg.nethttps://github.com/supatt-lab/r3cseq/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	r3cseq_1.43.0.tar.gz
Windows二进制	r3cseq_1.43.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	R3CSEQ_1.43.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3cseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/r3cseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/r3cseq/
软件包下载报告	下载统计