rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

这是发展rBiopaxParser版本;稳定发布版本请参见rBiopaxParser．

解析BioPax文件并在R中表示它们

Bioconductor版本:开发(3.16)

解析BioPAX文件并在R中表示它们，目前支持BioPAX级别2和级别3。

作者:弗兰克·克莱默

维护者:Frank Kramer < Frank . Kramer at informatik. uniaugsburg .de>

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化Bioc devel BiocManager的用法::install(version='devel') BiocManager::install("rBiopaxParser")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“rBiopaxParser”)

PDF	R脚本	rBiopaxParser装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，软件
版本	2.37.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (R-3.0)(9年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.0),data.table
进口	XML
链接
建议	Rgraphviz，RCurl，图，RUnit，BiocGenerics，RBGL，igraph
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
取决于我
进口我	pwOmics
建议我	AnnotationHub，NetPathMiner
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	rBiopaxParser_2.37.0.tar.gz
Windows二进制	rBiopaxParser_2.37.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	rBiopaxParser_2.37.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rBiopaxParser
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/rBiopaxParser/
包下载报告	下载数据