rgadem

doi：10.18129/b9.bioc.rgadem

这是发展rgadem的版本；对于稳定版本，请参阅rgadem。

从头图案发现

生物导体版本：开发（3.16）

RGADEM是用于大规模基因组序列数据的Noknot Motif Discovery工具。这是一个开源R软件包，基于GADEM软件。

作者：Arnaud Droit，Raphael Gottardo，Gordon Robertson和Leiping Li

维护者：arnaud droit

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rgadem”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ rgadem”）

PDF	R脚本	RGADEM用户指南
PDF		参考手册

细节

生物浏览	chipseq，，，，芯片，，，，微阵列，，，，主题，，，，测序，，，，软件
版本	2.45.0
在生物导体中	Bioc 2.6（R-2.11）（12年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 2.11.0），生物弦，，，，iranges，，，，BSGENOME， 方法，seqlogo
进口	生物弦，，，，基因组机，方法，图形，seqlogo
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，rtracklayer
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我	tcgaworkflow
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rgadem_2.45.0.tar.gz
Windows二进制	rgadem_2.45.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgadem
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rgadem
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rgadem/
软件包下载报告	下载统计