RGSEPD

doi：10.18129/b9.bioc.rgsepd

这是发展RGSEPD的版本;对于稳定版本，请参阅RGSEPD。

基因集富集 /投影显示

生物导体版本：开发（3.16）

R/GSEPD是R/gsepd，用于R/gsepd通过自动化差分表达式（使用DESEQ2），然后是基因集富集（带有Goseq），最后是N二维，用于帮助消除歧义的RIDAMINAD转录组样品（转录本ID时RNA-Seq计数的矩阵）（RNA-Seq计数的矩阵）。投影以量化每个样品都像任何一种治疗组一样。

作者：卡尔·斯塔姆（Karl Stamm）

维护者：karl stamm

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ rgsepd”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ rgsepd”）

PDF	R脚本	RGSEPD软件包简介
PDF		参考手册
文本		读书我
文本		消息

细节

生物浏览	差异性，，，，基因烯，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，软件
版本	1.29.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（7。5年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.2.0），deseq2，，，，Goseq（> = 1.28）
进口	GPLOTS，，，，Biomart，，，，org.hs.eg.db，，，，go.db，，，，总结性特征，，，，AnnotationDbi
链接
建议	引导， 工具，生物基因，，，，尼特，，，，Xtable
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	RGSEPD_1.29.0.TAR.GZ
Windows二进制	RGSEPD_1.29.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	RGSEPD_1.29.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rgsepd
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rgsepd
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rgsepd/
软件包下载报告	下载统计