RMSPC

doi：10.18129/b9.bioc.rmspc

这是发展RMSPC的版本;对于稳定版本，请参阅RMSPC。

多个样本峰通话

生物导体版本：开发（3.16）

RMSPC软件包使用R运行MSPC（多个样本峰调用）软件。芯片seq样品的分析输出了许多富集区域（通常称为“峰”），每个区域都表明蛋白-DNA相互作用或特定的染色质修饰。分析复制样品时，预计将重叠峰。因此，这种反复的证据可用于局部降低接受峰值所需的最低意义。MSPC使用复制实验中的合并证据来评估峰值呼叫输出，营救峰值并减少误报。它需要任何数量的重复作为输入，并提高对每个峰的峰值通话的灵敏度和特异性，并确定输入样本之间的共识区域。

作者：Vahid Jalili [aut]，Marzia Angela Cremona [AUT]，Fernando Palluzzi [aut]，Meriem Bahda [Aut，Cre]

维护者：gmail.com上的meriem bahda

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ rmspc”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

BrowseVignettes（“ RMSPC”）

html	R脚本	RMSPC软件包的用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	chipseq，，，，芯片奇普，，，，DataImport，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.3.0
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看
进口	processx，，，，生物管理器，，，，rtracklayer，统计，工具，方法，基因组机，，，，Stringr
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，测试（> = 3.0.0）
系统要求	.NET 5.0
增强
URL	https://genometric.github.io/mspc/
BugReports	https://github.com/genometric/mspc/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	rmspc_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	rmspc_1.3.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rmspc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/rmspc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/rmspc/
软件包下载报告	下载统计