这是发展咆哮的版本;对于稳定版本,请参阅怒吼。
生物导体版本:开发(3.16)
从已知的替代位点和从标准RNA-SEQ实验获得的比对开始,确定了APA位点的优先使用,并比较了两个生物条件。
作者:Elena Grassi
维护者:elena grassi
引用(从r内,输入引用(“咆哮”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ roar”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“咆哮”)
R脚本 | 从RNA-seq对齐中识别差异APA使用 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 高通量序列,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录 |
版本 | 1.33.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(8。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.0.1) |
进口 | 方法,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,基因组签名(> = 0.99.4),rtracklayer,,,,GenomeInfodB |
链接 | |
建议 | rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/vodkatad/roar/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | roar_1.33.0.tar.gz |
Windows二进制 | roar_1.33.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | roar_1.33.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/咆哮 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/roar/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
文档»
生物导体