怒吼

doi:10.18129/b9.bioc.roar

这是发展咆哮的版本;对于稳定版本,请参阅怒吼

从RNA-seq对齐中识别差异APA使用

生物导体版本:开发(3.16)

从已知的替代位点和从标准RNA-SEQ实验获得的比对开始,确定了APA位点的优先使用,并比较了两个生物条件。

作者:Elena Grassi

维护者:elena grassi

引用(从r内,输入引用(“咆哮”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ roar”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“咆哮”)

PDF R脚本 从RNA-seq对齐中识别差异APA使用
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 高通量序列,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 1.33.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(8。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.0.1)
进口 方法,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,总结性特征,,,,基因组签名(> = 0.99.4),rtracklayer,,,,GenomeInfodB
链接
建议 rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14,,,,测试
系统要求
增强
URL https://github.com/vodkatad/roar/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 roar_1.33.0.tar.gz
Windows二进制 roar_1.33.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) roar_1.33.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/roar
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/咆哮
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/roar/
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