这是发展RQT的版本;对于稳定版本,请参阅RQT。
生物导体版本:开发(3.16)
尽管现代GWAS方法最近取得了进步,但仍然是解决整个基因而不是单个变体的效应大小和相应的p值的重要问题。R-软件包RQT提供基因级GWAS荟萃分析。有关更多信息,请参见:Lee等人(2016年),生物信息学,32(17),I611-I619,I611-I619,参见:“下一代测序数据的基因 - 设定关联测试”,
作者:I。Y. Zhbannikov,K。G. Arbeev,A。I. Yashin。
维护者:iyala Y. Zhbannikov
引用(从r内,输入引用(“ RQT”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ rqt”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ RQT”)
html | R脚本 | RQT软件包的教程 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | Genomewideassociation,,,,委托人,,,,回归,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,生存 |
版本 | 1.23.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(5年) |
执照 | GPL |
要看 | r(> = 3.4),总结性特征 |
进口 | 统计,矩阵,,,,ropls, 方法,车,,,,运行,,,,代码,,,,组合,,,,Glmnet,utils,请 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/izhbannikov/rqt |
BugReports | https://github.com/izhbannikov/rqt/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rqt_1.23.0.tar.gz |
Windows二进制 | rqt_1.23.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | RQT_1.23.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqt |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rqt |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/rqt/ |
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