Sangeranalyser

doi：10.18129/b9.bioc.sangeranalyser

这是发展Sangeranalyser的版本；对于稳定版本，请参阅Sangeranalyser。

Sangeranalyser：用于分析R中的Sanger序列数据的函数套件

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包在Sangerseqr上构建，允许用户从Sanger测序读取的集合中创建重叠群。它为许多常见的动作提供了广泛的选项，包括读取修剪，检测次级峰以及使用参考序列检测indels。所有参数都可以在R或相关的光泽应用中进行交互性调整。有大量的在线文档，该软件包可以输出详细的HTML报告，包括色谱图。

作者：Rob lanfear

维护者：gmail.com>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = deS ='devel'）biocmanager :: install（“ sangeranalyser”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Sangeranalyser”）

html	R脚本	Sangeranalyser
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	结盟，，，，GUI，，，，遗传学，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，Sangerseq，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.7.1
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 4.0.0），Stringr，，，，猿，，，，生物弦，，，，解码， 平行，RESHAPE2，，，，Phangorn，，，，Sangerseqr，，，，栅格，，，，闪亮的，，，，发光的dashboard，，，，Shinyjs，，，，Data.Table，，，，情节，，，，DT，，，，Zeallot，，，，excelr，，，，Shinycsssloaders，，，，ggdendro，，，，闪亮的widgets，，，，OpenXLSX， 工具，rmarkDown（> = 2.9），尼特（> = 1.33），seqinr，，，，生物使用，，，，记录器
进口
链接
建议	测试（> = 2.1.0）
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	sangeranalyser_1.7.1.tar.gz
Windows二进制	sangeranalyser_1.7.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Sangeranalyser_1.7.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangeranalyser
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/sangeranalyser
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/sangeranalyser/
软件包下载报告	下载统计