SCDD

doi：10.18129/b9.bioc.scdd

这是发展SCDD的版本;对于稳定版本，请参阅SCDD。

单细胞RNA-seq数据的混合模型，以识别具有差异分布的基因

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包实现了一种使用灵活的Dirichlet工艺混合模型分析单细胞RNA-SEQ数据的方法。具有差异表达分布的基因被分为两种条件之间的几种有趣的差异模式。该软件包还包括用于模拟数据的功能，这些模式来自负二项式分布。

作者：Keegan Korthauer [CRE，AUT]

维护者：Keegan Korthauer

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ scdd”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ SCDD”）

PDF	R脚本	SCDD Quickstart
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	贝叶斯，，，，聚类，，，，差异性，，，，免疫学，，，，多重组合，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件，，，，可视化
版本	1.21.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 3.5.0）
进口	字段，，，，mclust，，，，生物比较，，，，异常值，，，，GGPLOT2，，，，EBSEQ，，，，手臂，，，，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，grdevices，图形，统计信息，S4VECTORS，，，，斯克兰
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，栅格
系统要求
增强
URL	https://github.com/kdkorthauer/scdd
BugReports	https://github.com/kdkorthauer/scdd/issues
取决于我
进口我
建议我	飞溅
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scdd_1.21.0.tar.gz
Windows二进制	scdd_1.21.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	scdd_1.21.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scdd
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/scdd
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/scdd/
软件包下载报告	下载统计