scfeaturefilter

doi:10.18129/b9.bioc.scfeaturefilter

这是发展ScfeatureFilter的版本;对于稳定版本,请参阅scfeaturefilter

基于相关的单细胞RNASEQ数据质量过滤的方法

生物导体版本:开发(3.16)

JOSHI实验室开发的基于相关方法的R实现,用于分析和过滤处理的单细胞RNASEQ数据。它返回仅包含基因表达值的数据的过滤版本,而不受系统噪声影响。

作者:Angeles Arzalluz-Luque [aut],Guillaume Devailly [Aut,Cre],Anagha Joshi [aut]

维护者:guillaume devailly > gdevailly>

引用(从r内,输入引用(“ scfeaturefilter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ scfeaturefilter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ scfeaturefilter”)

html R脚本 ScfeatureFilter简介
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 基因表达,,,,免疫学,,,,预处理,,,,rnaseq,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.17.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6)
进口 dplyr(> = 0.7.3),GGPLOT2(> = 2.1.0),马格里特(> = 1.5),rlang(> = 0.1.2),蒂布尔(> = 1.3.4),统计,方法
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,scrnaseq,,,,牛仔图
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scfeaturefilter_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 scfeaturefilter_1.17.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) scfeaturefilter_1.17.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scfeaturefilter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scfeaturefilter
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/scfeaturefilter/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户