sccomp

doi：10.18129/b9.bioc.sccomp

这是发展SCCOMP的版本；对于稳定版本，请参阅sccomp。

单细胞数据的组成和异质性的强大异常值估计

生物导体版本：开发（3.16）

一种用于测试单细胞数据的差异组织组成的强大且异常感知的方法。该模型可以推断组织组成和异质性的变化，并可以基于任何现有数据集生成逼真的数据模拟。该模型还可以将知识从大量集成数据集转移，以进一步提高准确性。

作者：Stefano Mangiola [AUT，CRE]

维护者：gmail.com>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ sccomp”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ SCOMP”）

html	R脚本	SCOMP软件包的概述
PDF		参考手册

细节

生物浏览	聚类，，，，基因表达，，，，免疫学，，，，正常化，，，，rnaseq，，，，测序，，，，Singlecell，，，，软件，，，，转录组学
版本	1.1.0
在生物导体中	Bioc 3.15（R-4.2）（<6个月）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1.0）
进口	方法，RCPP（> = 0.12.0），rcppparallel（> = 5.0.1），rstantools（> = 2.1.1），rstan（> = 2.18.1），seuratObject，，，，Singlecellexperiment， 平行，dplyr，，，，花花公子，，，，purrr，，，，马格里特，，，，rlang，，，，蒂布尔，，，，引导，，，，生命周期，统计tidyselect，utils，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，拼布，，，，福卡，，，，readr，，，，秤，，，，Stringr
链接	BH（> = 1.66.0），RCPP（> = 0.12.0），rcppeigen（> = 0.3.3.3.0），rcppparallel（> = 5.0.1），rstan（> = 2.18.1），Stanheaders（> = 2.18.0）
建议	生物使用，，，，测试（> = 3.0.0），降价，，，，GGPLOT2，，，，尼特，，，，tidyseurat，，，，tidysinglecellexperiment
系统要求	gnu做
增强	Furrr，，，，渡轮
URL	https://github.com/stemangiola/sccomp
BugReports	https://github.com/stemangiola/sccomp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	sccomp_1.1.0.tar.gz
Windows二进制	sccomp_1.1.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	sccomp_1.1.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sccomp
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/sccomp
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/sccomp/
软件包下载报告	下载统计