SCP

doi：10.18129/b9.bioc.scp

这是发展SCP的版本；对于稳定版本，请参阅SCP。

基于质谱的单细胞蛋白质组学数据分析

生物导体版本：开发（3.16）

用于操纵，处理和分析基于质谱的单细胞蛋白质组学（SCP）数据的实用程序功能。该软件包是针对SCP应用程序设计的“ Qfeatures”软件包的扩展程序。

作者：Christophe Vanderaa [AUT，CRE]，Laurent Gatto [AUT]

维护者：christophe vanderaa

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（scp“ scp”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ SCP”）

html	R脚本	``scp'的高级用法
html	R脚本	使用ReadSCP加载数据
html	R脚本	简而言之
html	R脚本	单细胞蛋白质组学数据处理和分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	蜂窝基，，，，基因表达，，，，质谱，，，，预处理，，，，蛋白质组学，，，，Singlecell，，，，软件
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.0），qfeatures（> = 1.3.5）
进口	方法，统计，utils，Singlecellexperiment，，，，总结性特征，，，，多亚sayExexperiment，，，，mscoreutils，，，，矩阵，，，，S4VECTORS，，，，dplyr，，，，马格里特，，，，rlang
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，拼布，，，，GGPLOT2，，，，算，，，，评分，，，，SVA，，，，预处理，，，，VSN，，，，UWOT
系统要求
增强
URL	https://uclouvain-cbio.github.io/scp
BugReports	https://github.com/uclouvain-cbio/scp/issues
取决于我
进口我
建议我	scpdata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	scp_1.7.0.0.tar.gz
Windows二进制	SCP_1.7.0.ZIP（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	SCP_1.7.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scp
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/scp
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/scp/
软件包下载报告	下载统计