seqCNA

DOI:10.18129 / B9.bioc.seqCNA

这是发展seqCNA版本;稳定的发布版本,请参阅seqCNA。

癌症数据拷贝数高通量测序分析

Bioconductor版本:发展(3.17)

拷贝数快速癌症高通量测序数据的分析与总结,广泛筛选和改进的归一化

作者:大卫Mosen-Ansorena

维护人员:大卫Mosen-Ansorena < dmosen。gn在cicbiogune.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“seqCNA”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“seqCNA”)

PDF	R脚本	seqCNA.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation,遗传学,测序,软件
版本	1.45.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.0),很高兴(> = 2.14),doSNOW(> = 1.0.5),adehabitatLT(> = 0.3.4),seqCNA.annot(> = 0.99),方法
进口
链接
建议
SystemRequirements	samtools
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	爬虫
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	seqCNA_1.45.0.tar.gz
Windows二进制	seqCNA_1.45.0.zip
macOS二进制(x86_64)	seqCNA_1.45.0.tgz
macOS二进制(arm64)	seqCNA_1.45.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqCNA
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ seqCNA
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/seqCNA/
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/seqCNA/
包下载报告	下载数据