seqlogo

doi：10.18129/b9.bioc.seqlogo

这是发展Seqlogo的版本;对于稳定版本，请参阅seqlogo。

DNA序列比对的序列徽标

生物导体版本：开发（3.16）

Seqlogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵，并绘制Schneider和Stephens（1990）引入的相应序列徽标。

作者：Oliver Bembom [Aut]，Robert Ivanek [Aut，Cre]

维护者：Robert Ivanek

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ seqlogo”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ seqlogo”）

html	R脚本	DNA序列比对的序列徽标
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	测序，，，，软件
版本	1.63.0
在生物导体中	Bioc 2.0（R-2.5）（15年）
执照	LGPL（> = 2）
要看	R（> = 4.2），方法，网格
进口	Stats4，Grdevices
链接
建议	尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/ivanek/seqlogo/issues
取决于我	结肠管制，，，，rgadem
进口我	IGVR，，，，兴趣，，，，pwmenrich，，，，rgadem，，，，riboseqr，，，，碎片，，，，TFBSTOOLS
建议我	Bcrank，，，，difflogo，，，，玛格尔，，，，主题，，，，主题，，，，Universalmotif
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	seqlogo_1.63.0.tar.gz
Windows二进制	seqlogo_1.63.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	seqlogo_1.63.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqlogo
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqlogo
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/seqlogo/
软件包下载报告	下载统计