seqsetvis

doi：10.18129/b9.bioc.seqsetvis

这是发展SeqsetVis的版本;对于稳定版本，请参阅seqsetvis。

基于设置的下一代测序数据的可视化

生物导体版本：开发（3.16）

SEQSETVIS可以在下一代测序数据中对基因组位点集的可视化和分析。尽管SEQSETVI是为了比较Mulitple芯片seq样品的比较，但该软件包是域 - 无义的，允许处理多个基因组坐标文件（床单式文件）和信号文件（BAM文件中的BigWig文件堆积）。

作者：Joseph R Boyd [AUT，CRE]

维护者：Joseph R Boyd

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ seqsetvis”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ seqsetvis”）

html	R脚本	概述和用例
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	chipseq，，，，多重组合，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.17.0
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（4年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.6），GGPLOT2
进口	牛仔图，，，，Data.Table，，，，欧拉，，，，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，ggplotify，grdevices，网格，iranges，，，，林玛， 方法，pbapply，，，，pbmcapply，，，，PNG，，，，rcolorbrewer，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS，统计insctr
链接
建议	Biocfilecache，，，，生物管理器，，，，生物使用，，，，Chippeakanno，，，，COVR，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	seqsetvis_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	seqsetvis_1.17.0.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	seqsetvis_1.17.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqsetvis
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqsetvis
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/seqsetvis/
软件包下载报告	下载统计