简化

doi：10.18129/b9.bioc.simplifyenrichment

这是发展简化的版本；对于稳定版本，请参阅简化。

简化功能丰富结果

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包中插入了一种新的聚类算法“二进制切割”，用于函数项的聚类相似性矩阵。它还提供了可视化，总结和比较聚类的功能。

作者：Zuguang Gu [AUT，CRE]

维护者：Zuguang gu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ Simpleifyenrichment”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“简化”）

html	R脚本	一个闪亮的应用程序，可以交互可视化聚类结果
html	R脚本	简化功能丰富结果
html	R脚本	单词云注释
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	聚类，，，，去，，，，基因烯，，，，软件，，，，可视化
版本	1.7.1
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	r（> = 3.6.0），生物基因， 网格
进口	Gosemsim，，，，复杂的图像（> = 2.7.4），循环，，，，getoptlong，，，，消化，，，，Tm值，，，，go.db，，，，org.hs.eg.db，，，，AnnotationDbi，，，，大满贯， 方法，线索，grdevices，图形，统计，utils，proxyc，，，，矩阵，，，，簇（> = 1.14.2），色彩空间，，，，全球选择（> = 0.1.0）
链接
建议	尼特，，，，GGPLOT2，，，，牛仔图，，，，mclust，，，，APCLUSTER，，，，MCL，，，，dbscan，，，，Igraph，，，，栅格，，，，DynamiCtreCut，，，，测试，，，，栅格图，，，，clusterProfiler，，，，msigdbr，，，，剂量，，，，do.db，，，，Reactome.db，，，，Flexclust，，，，生物管理器，，，，Interactivecomplexheatmap（> = 0.99.11），闪亮的，，，，发光的dashboard，，，，可乐，，，，Hu6800.db，，，，rmarkDown，，，，GeneFilter，，，，网格文本，，，，FPC
系统要求
增强
URL	https://github.com/jokergoo/simplifyenrichmenthttps://simplifyenrichment.github.io
取决于我
进口我
建议我	可乐，，，，Interactivecomplexheatmap
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	SimplifyEnrichment_1.7.1.tar.gz
Windows二进制	SimplifyEnrichment_1.7.1.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	SimplifyEnrichment_1.7.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simplifyenrichment
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/simplefifyenrichment
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/simplifyenrichment/
软件包下载报告	下载统计