快照

doi：10.18129/b9.bioc.snapcount

这是发展Snapcount的版本；对于稳定版本，请参阅快照。

用于与Snaptron接口的R/Bioconductor套件，用于快速查询表达计数

生物导体版本：开发（3.16）

Snapcount是Snaptron Web服务的客户端接口，该界面服务支持基因名称或基因组区域的查询。结果包括根据RNA-seq样品的比对得出的原始表达计数和/或每样本样本中一个或多个区域/基因的各种表达量度（例如，剪接百分比）。

作者：Rone Charles [AUT，CRE]

维护者：rone charles

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ snapcount”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Snapcount”）

html	R脚本	快速快速开始指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，DataImport，，，，基因表达，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件
版本	1.9.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.0.0）
进口	R6，，，，httr，，，，rlang，，，，purrr，，，，jsonlite，，，，断言，，，，Data.Table，，，，矩阵，，，，马格里特， 方法，Stringr，统计iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征
链接
建议	生物管理器，，，，位64，，，，COVR，，，，编织，，，，尼特（> = 1.6），DevTools，，，，生物使用（> = 2.5.19），rmarkDown（> = 0.9.5），测试（> = 2.1.0）
系统要求
增强
URL	https://github.com/langmead-lab/snapcount
BugReports	https://github.com/langmead-lab/snapcount/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	snapcount_1.9.0.tar.gz
Windows二进制	snapcount_1.9.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	snapcount_1.9.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapcount
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/snapcount
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/snapcount/
软件包下载报告	下载统计