球形结构

DOI:10.18129 / B9.bioc.snm

这是发展snm版本;稳定版请参见球形结构．

微阵列的监督归一化

Bioconductor版本:开发(3.16)

SNM是一种特别为高通量基因组数据规范化设计的建模策略。我们方法的基本前提是，您的数据是我们所说的研究特定变量的函数。这些变量要么是代表统计分析目标的生物变量，要么是代表来自数据的实验或生物设置的因素的调整变量。SNM方法旨在同时对所有研究特定变量进行建模，以便更准确地描述感兴趣的生物学或临床变量。

作者:Brig Mecham和John D. Storey

维护者:John D. Storey

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("snm")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“核材料”)

PDF	R脚本	球形结构教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,ExonArray,GeneExpression,微阵列,多通道,MultipleComparison,OneChannel,预处理,质量控制,软件,转录,TwoChannel
版本	1.45.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(11年)
许可证	LGPL
取决于	R (>= 2.12.0)
进口	corpcor,lme4(>= 1.0)，样条曲线
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	边缘,ExpressionNormalizationWorkflow
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	snm_1.45.0.tar.gz
Windows二进制	snm_1.45.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	snm_1.45.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snm
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/snm
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/snm/
软件包下载报告	下载数据