这是发展Splinetimer的版本;对于稳定版本,请参阅碎片。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包为基因表达时间谱系数据的差异基因表达分析提供了功能。使用天然立方样条回归模型。鉴定的基因可以进一步用于途径富集分析和/或时间依赖基因调节关联网络的重建。
作者:Agata Michna
维护者:Herbert Braselmann
引用(从r内,输入引用(“ Splinetimer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ splinetimer”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Splinetimer”)
R脚本 | 碎片 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,NetworkEnrichment,,,,网络引导,,,,回归,,,,软件,,,,时间科 |
版本 | 1.25.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(6年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3),生物酶,,,,Igraph,,,,林玛,,,,gseabase,,,,gtools,花键,Genenet(> = 1.2.13),纵(> = 1.1.12),FIS |
进口 | |
链接 | |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | splinetimer_1.25.0.tar.gz |
Windows二进制 | splinetimer_1.25.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | splinetimer_1.25.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splinetimer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/splinetimer |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/splinetimer/ |
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