碎片

doi:10.18129/b9.bioc.splinetimer

这是发展Splinetimer的版本;对于稳定版本,请参阅碎片

时间顺序差异基因表达数据分析使用样条回归模型,然后是基因关联网络重建

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包为基因表达时间谱系数据的差异基因表达分析提供了功能。使用天然立方样条回归模型。鉴定的基因可以进一步用于途径富集分析和/或时间依赖基因调节关联网络的重建。

作者:Agata Michna

维护者:Herbert Braselmann ,Martin Selmansberger

引用(从r内,输入引用(“ Splinetimer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ splinetimer”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Splinetimer”)

PDF R脚本 碎片
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 差异性,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,NetworkEnrichment,,,,网络引导,,,,回归,,,,软件,,,,时间科
版本 1.25.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(6年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3),生物酶,,,,Igraph,,,,林玛,,,,gseabase,,,,gtools,花键,Genenet(> = 1.2.13),(> = 1.1.12),FIS
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构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 splinetimer_1.25.0.tar.gz
Windows二进制 splinetimer_1.25.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) splinetimer_1.25.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splinetimer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/splinetimer
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/splinetimer/
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