突触

doi：10.18129/b9.bioc.synapsis

这是发展突触的版本；对于稳定版本，请参阅突触。

R套件以自动进行减数分裂过程中双链断裂修复的分析

生物导体版本：开发（3.16）

Sytapsis是一种用于减数分裂免疫荧光数据集的自动化（无偏见和可再现）分析的生物通用软件包。该软件的主要功能可以i）识别减素预言中的细胞，这些细胞由Synaptonemal复合轴或中心元素蛋白标记，ii）隔离单个突发型复合物并测量其物理长度，iii）量化焦点并与Synaptonemal conaptonemal conaptonemal conaptonemal copalemal confimptes recote复合物，iv）测量突触复合物相关灶之间的干扰。该软件具有扩展到多种物种的应用，并分析了标记减数分裂预言染色体的其他蛋白质。该软件将减数分裂免疫荧光图像转换为与机器学习方法兼容的R数据帧。给定减数分裂扩散载玻片的一组显微镜图像，突触围绕单个单个细胞周围的突触作物图像，以每个细胞为基础对链上进行共定位焦点，并测量任何给定链的焦点之间的距离。

作者：露西·麦克尼尔[AUT，CRE，CPH]，Wayne Crismani [Rev，CTB]

维护者：露西·麦克尼尔（Lucy McNeill）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ Synapsis”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“突触”）

html	R脚本	使用synapsis
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	Singlecell，，，，软件
版本	1.3.0
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（1年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.1）
进口	ebimage，统计，utils，图形
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试（> = 3.0.0），GGPLOT2，，，，平淡无奇，，，，生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Synapsis_1.3.0.tar.gz
Windows二进制	Synapsis_1.3.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Synapsis_1.3.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synapsis
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/突触
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/synapsis/
软件包下载报告	下载统计