翻译

doi：10.18129/b9.bioc.translatome

这是发展translatome的版本；对于稳定版本，请参阅翻译。

多个基因表达之间的比较

生物导体版本：开发（3.16）

在不同水平的基因表达（转录组，翻译组，蛋白质组）之间比较两种生物条件（治疗，未经治疗的，患病与正常，突变体与野生型）的比较，检测差异表达的基因（DEG），使用了几种统计方法：等级产品，翻译效率，t检验，Limma，Anota，Deseq，Edger。使用散点图，直方图，MA图，标准偏差（SD）图，变异系数（CV）图绘制结果的可能性。在先前针对两个表达水平的DEG列表中检测明显富集后的转录后调节因子（RBP，miRNA等）和基因本体术语。GO术语的比较仅在其中一个级别或两者中丰富。来自两个表达式水平的丰富GO术语列表之间的语义相似性得分的计算。视觉检查和比较富集的术语与热图，雷达图和小花。

作者：Toma Tebaldi，Erik Dassi，Galena Kostoska

维护者：toma tebaldi ，erik dassi

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ translatome”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Translatome”）

PDF	R脚本	翻译
PDF		参考手册

细节

生物浏览	生物信息学，，，，细胞生物学，，，，差异性，，，，去，，，，基因表达，，，，结肠管制，，，，高通量序列，，，，微阵列，，，，多蛋白酶，，，，QualityControl，，，，规定，，，，软件
版本	1.35.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（8。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 2.15.0），方法，林玛，，，，Sigpathway，，，，Anota，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，rankprod，，，，topgo，，，，org.hs.eg.db，，，，Gosemsim，，，，热倍，，，，GPLOTS，，，，plotrix，，，，生物酶
进口
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建议
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Translatome_1.35.0.tar.gz
Windows二进制	Translatome_1.35.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Translatome_1.35.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/translatome
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/translatome
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/translatome/
软件包下载报告	下载统计