时间表学

doi：10.18129/b9.bioc.Timeomics

这是发展时间组的版本；对于稳定版本，请参阅时间表学。

时间课程多摩斯数据集成

生物导体版本：开发（3.16）

Timeomics是一个通用数据驱动的框架，可整合在同一生物样品上测量的多摩斯纵向数据，并选择与同一样本组内具有强关联的关键时间特征。时间表的主要步骤是：1。构图和特定时间的归一化和过滤步骤；2.将每个生物学建模为一个时间表达曲线；3.随着时间的推移，具有相同表达式剖面的聚类特征；4.事后验证步骤。

作者：Antoine Bodein [AUT，CRE]，Olivier Chapleur [aut]，Kim-Anh Le Cao [aut]，Arnaud Droit [aut]

维护者：Antoine Bodein

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ Timeomics”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

PDF		参考手册

细节

生物浏览	分类，，，，聚类，，，，维度，，，，特征提取，，，，遗传，，，，免疫学，，，，代谢组学，，，，宏基因组学，，，，微阵列，，，，多重组合，，，，蛋白质组学，，，，回归，，，，测序，，，，软件，，，，时间科
版本	1.9.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	GPL-3
要看	混合学，R（> = 4.0）
进口	dplyr，，，，花花公子，，，，蒂布尔，，，，purrr，，，，马格里特，，，，GGPLOT2，，，，Stringr，，，，Ggrepel，，，，propr，，，，lmtest，，，，plyr
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，雪，，，，平淡无奇，，，，Igraph，，，，GPLOTS
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/abodein/timeomics/issues
取决于我
进口我
建议我	Netomics
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timeomics
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/时间表学
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/timeomics/
软件包下载报告	下载统计