三元

doi：10.18129/b9.bioc.triplex

这是发展triplex的版本；对于稳定版本，请参阅三元。

在DNA中搜索和可视化分子内三形形成序列

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包提供了用于识别和可视化DNA序列中潜在分子内三形模式的功能。主要功能是检测能够以更大的序列折叠成分子内三分（H-DNA）的子序列的位置。电势H-DNA（三）应由尽可能多的炮核苷酸三重态制成。该软件包包括可视化，显示1D，2D或3D中的确切基本配对。

作者：Jiri Hon，Matej Lexa，Tomas Martinek和Kamil Rajdl的贡献

维护者：jiri hon

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（decon ='devel'）biocmanager :: install（“ triplex”）的用法

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Triplex”）

PDF	R脚本	Triplex用户指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	结肠管制，，，，测序，，，，软件
版本	1.37.0
在生物导体中	Bioc 2.12（R-3.0）（9年）
执照	bsd_2_clause +文件执照
要看	r（> = 2.15.0），S4VECTORS（> = 0.5.14），iranges（> = 2.5.27），xvector（> = 0.11.6），生物弦（> = 2.39.10）
进口	方法，网格，基因组机
链接	S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦
建议	RGL（> = 0.93.932），bsgenome.celegans.ucsc.ce10，，，，rtracklayer
系统要求
增强
URL	http://www.fi.muni.cz/~lexa/triplex/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	triplex_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	triplex_1.37.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	triplex_1.37.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/triplex
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/三
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/triplex/
软件包下载报告	下载统计