发现

doi：10.18129/b9.bioc.uncoverapplib

这是发展uncoverapplib的版本；对于稳定版本，请参阅发现。

交互式图形应用，用于临床评估基本对级别序列覆盖范围

生物导体版本：开发（3.16）

一套闪亮的应用程序，其中包含一套图形和统计工具，以支持低覆盖区域的临床评估。它显示三个网页，每个网页提供了不同的分析模块：覆盖范围分析，通过等位基因频率应用程序和二项式分布计算AF。UncoverApp提供了给定目标文件或基因名称的覆盖范围的统计摘要。

作者：Emanuela Iovino [CRE，AUT]，Tommaso Pippucci [aut]

维护者：emanuela iovino

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ undoverapplib”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ uncoverapplib”）

html	R脚本	发现
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	注解，，，，覆盖范围，，，，软件，，，，可视化
版本	1.7.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看
进口	降价，，，，闪亮的，，，，Shinyjs，，，，丝绸，，，，闪亮的widgets，，，，Shinycsssloaders，，，，DT，，，，GVIZ，homo.sapiens，OpenXLSX，，，，需求，，，，Stringr，org.hs.eg.db，txdb.hsapiens.ucsc.hg38。Biocfilecache，，，，Rappdirs，txdb.hsapiens.ucsc.hg19.rlist，utils，S4VECTORS，Ensdb.hsapiens.v75，Ensdb.hsapiens.v86，有机体，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，processx，，，，rsamtools，，，，基因组机
链接
建议	生物使用，，，，尼特，，，，测试，，，，rmarkDown，，，，dplyr
系统要求
增强
URL	https://github.com/manuelaio/uncoverapplib
BugReports	https://github.com/manuelaio/uncoverapplib/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	uncoverApplib_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）	uncoverApplib_1.7.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uncoverapplib
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/uncoverapplib
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/uncoverapplib/
软件包下载报告	下载统计