这是发展viper版本;稳定版请参见毒蛇.
Bioconductor版本:开发(3.16)
从基因表达数据推断蛋白质活性,包括VIPER和msVIPER算法
作者:Mariano J Alvarez
维护者:Mariano J Alvarez
引文(从R内,输入引用(“毒蛇”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("viper")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“毒蛇”)
R脚本 | 使用毒蛇 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | FunctionalPrediction,GeneExpression,GeneRegulation,NetworkEnrichment,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.31.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(8年) |
许可证 | 文件许可证 |
取决于 | R (>= 2.14.0),Biobase、方法 |
进口 | mixtools,统计,平行,e1071,KernSmooth |
链接 | |
建议 | bcellViper |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | aracne.networks,火神 |
进口我 | diggit,diggitdata,多萝西娅,研制 |
建议我 | 解耦,MethReg,现代艺术博物馆 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | viper_1.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | viper_1.31.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | viper_1.31.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/viper |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/viper |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/viper/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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