西瓜

DOI:10.18129 / B9.bioc.wateRmelon

这是发展西瓜版;稳定发布版本请参见西瓜．

Illumina 450和EPIC甲基化阵列归一化和度量

Bioconductor版本:开发(3.16)

15种beta版本和3种性能指标，以及由methylumi和minfi包生成的对象的方法。

作者:Leo C Schalkwyk [cre, aut]， Tyler J Gorrie-Stone [aut]， Ruth Pidsley [aut]， Chloe CY Wong [aut]， Nizar Touleimat [ctb]， Matthieu Defrance [ctb]， Andrew Teschendorff [ctb]， Jovana Maksimovic [ctb]， Louis Y El Khoury [ctb]，王昱成[ctb]

维护者:essex.ac.uk>的Leo C Schalkwyk

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用bio devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("西瓜")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“西瓜”)

超文本标记语言	R脚本	西瓜使用指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，微阵列，预处理，质量控制，软件，TwoChannel
版本	tripwire
在Bioconductor公司	BioC 2.12 (R-3.0)(9.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5.0)，Biobase，limma、方法、matrixStats，methylumi，光民，中华民国，IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19，illuminaio
进口	Biobase
链接
建议	RPMM，IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19，BiocStyle，knitr，rmarkdown，IlluminaHumanMethylationEPICmanifest，irlba，FlowSorted.Blood.EPIC，FlowSorted.Blood.450k，preprocessCore
SystemRequirements
增强了	minfi
URL
全靠我	bigmelon，skewr
进口我	冠军，肉
建议我	RnBeads
给我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	wateRmelon_2.3.0.tar.gz
Windows二进制	wateRmelon_2.3.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	wateRmelon_2.3.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/wateRmelon
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/西瓜
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/wateRmelon/
软件包下载报告	下载数据