SC3新闻SC3 1.5.5(发行日期:2017-10-19): *``scater`现在都基于`singlecellexperiment` class * s sc3`插槽已移至`singlecellexperiment的元数据插槽 *``'sc3'完全弃用了``sc3' *所有``scater''singlecellexperiment`类 * clustering逻辑尚未在所有SC3 1.3.7上更改(发布日期:2016-11-23): * rselenium功能性由于没有进一步的支持而被删除 *现在将所有结果(聚类和生物学)写入phenodata,并在交互式闪亮会话中删除了输入“ sceset”对象的输入“ sceset”对象 *'sceset'object *'sceset'object *'sceset'object *'sceset'object''和“单元格离线”选项卡的插槽现在可以在其他Heatmaps SC3 1.1.7(发布日期:2016-09-14)上可视化数据: *与“ Scater”软件包相加的集成 *添加了完整的非相互作用支持SC3 1.1.6(发布日期:2016-08-04): *使用RCCP的优化距离和共识计算 *优化了其他一些零件 *`sc3`现在最多2次1000个单元格数据集SC3 1.1.5(发布日期:2016-06-28): *添加svm.train.inds参数 - 它允许用户在选定的单元格SC3 0.99.37(发布日期:发布日期:2016-04-15): * tsne面板被添加到交互式会话中 *额外表已添加到输出中 - 它包含与输入表达式矩阵中单元格的顺序相对应的原始和新的单元格标签 *三个函数现在对应于生物解释的对应于生物学解释,可以手动使用:get_de_genes,get_marker_genes,get_outl_cells。有关更多详细信息,请参见他们的文档 *已修复了几个错误SC3 0.99.23(发布日期:2016-03-01): *主要重新设计 *添加了描述面板 *使用rselenium *修复了一个错误 *使用writexls库SC3添加了一个适当的Excel导出0.99.0(发布日期:2015-12-10): *第一版0.99.0已提交给生物导体