版本1.9.1的变化-------------------------- o修正了在R版本4.0中导致类(…)== "x"使用相关错误的编码。我们在anota2seqGetOutput函数的输出参数中添加了一个新的选项，更多细节可以在函数帮助中找到。o小插图的质量控制部分已经扩展了更多的细节，此外，我们添加了一个低标准化数据的质量控制示例作为参考。o我们从总mRNA和翻译mRNA的分析输出中删除了apvSlope和apvSlopeP列，因为这些值不用于RNA源差异表达分析。版本1.3.1 -------------------------- o修改了一个错误，在anota2seqPlotPvalues和anota2seqPlotFC中，如果有多个对比，则只选择1个对比时，对比度名称不会正确显示。使用带有自定义过滤参数的anota2seqRun函数maxP仍然基于maxPAdj为0.15。这已被修复，即当maxP过滤应用时，maxPAdj过滤器将被使用。在版本1.0.1的变化-------------------------- o我们改变语义缓冲下降为buffered (mRNA上)和缓冲上升为buffered (mRNA下)-所以解释更直观。o添加自定义选项anota2seqPlotFC和anotat2seqPlotPvalues函数修正了一个错误，其中一个统一的对象“regModes”正在被访问，导致一个没有信息的错误消息。修改版本0.99.1 --------------------------修改BiocStyle的latex2函数现在在包的devel版本中已弃用。取代它的乳胶()删除本月/ doc和构建/文件夹o更新手册页o anota2seqDataSetFromSE assayNum的默认值改为1 o anota2seq显示方法的格式(和次要的文本编辑的描述对象)o anota2seqSelSigGenes o小调sortBy参数相关的固定问题文本编辑消息给用户o修正关于阈值线anota2seqPlotFC o固定错误在anota2seqSelSigGenes useRVM = FALSE,只有一个基因被选中 CHANGES IN VERSION 0.99.0 -------------------------- o First submitted version