健壮的概率平均(战)是一个完全可伸缩probe-level预处理算法和短的寡核苷酸微阵列分析集合的大小,中等大小的标准数据集的任意大微阵列地图册涉及成千上万的样品,或者更多。
特殊包装可供Affymetrix基因表达数组和系统发育micoarrays (HITChip)。
战还提供了明确的数据驱动的探测特定亲和力和噪声的估计基于严格的概率模型和明显优于标准的RMA模型基准测试(NAR 2013),同时实现一个完整的可伸缩性。
中可用的方法R / Bioconductor,并记录在下面列出的出版物。对于所有的安装与使用说明,请查看战维基。
雷达分析方法已经被记载在这两个出版物。如果合适请引用:
一个完全可伸缩的在线预处理算法短的寡核苷酸微阵列地图册狮子座拉赫蒂,极光多浪迪警官,劳拉L值得信赖,艾尔维Brazma,约翰响。核酸研究的41 (10):e110, 2013年。
概率分析探测可靠性在研究基因差异表达与短的寡核苷酸阵列狮子座拉赫蒂劳拉l .值得Tero Aittokallio,撒母耳Kaski。IEEE / ACM事务计算生物学和生物信息学8 (1):217 - 2011。