### R代码来自vignette源的ngenome芯片。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:ngenomeschips。Rnw: 35-36 ################################################### 库(altcdfenvs ) ################################################### ### 代码块2号:ngenomeschips。Rnw: ################################################### 库(plasmodiumanophelescdf ) ################################################### ### 代码块3号:ngenomeschips。Rnw: 47-49 ################################################### planocdf < - wrapCdfEnvAffy (plasmodiumanophelescdf, 712年,712年,“plasmodiumanophelescdf”)打印(planocdf ) ################################################### ### 代码块数量4:ngenomeschips。Rnw: 60 - 62 ################################################### id < - geneNames (planocdf) id。pf < - id [grep(“^ pf”,id )] ################################################### ### 代码块5号:ngenomeschips。Rnw: 66 - 69 ################################################### ## 子集感兴趣的对象只保留探针集plcdf < - planocdf [id。pf)打印(plcdf ) ################################################### ### 代码块6号:ngenomeschips。Rnw: 77 - 82 ################################################### 文件名< -系统。file("exampleData"， " plasmodim - probset - ids. txt"， package="altcdfenvs")Pf <- scan(file = filename, what = "") PLCDF <- planocdf[ids.]pf)打印(plcdf ) ################################################### ### 代码块7号:ngenomeschips。Rnw: 86 - 88 ################################################### plcdf@envName < -“疟原虫id只“打印(plcdf)