流式细胞仪数据文件标准,版本FCS3.0

国际分析细胞学学会(ISAC)数据文件标准委员会

FCS 2.0版本见Cytometry 1990;11(3):323-32。

摘要

流式细胞术数据文件标准提供了在包含实验数据的文件范围内完整描述流式细胞术数据集所需的规范。1984年,第一个流式细胞仪数据文件标准格式FCS1.0被采用,该标准在1990年被修改为FCS2.0。我们在此报告提议的下一代流式细胞仪标准数据文件格式FCS3.0。该标准的主要目标是提供统一的文件格式,允许一种类型的采集硬件和软件创建的文件被另一种类型的采集硬件和软件分析。提议的FCS3.0标准通过保留基本的FCS文件结构来保持与以前版本的向后兼容性。FCS结构要求文件中的每个数据集包含三个段:HEADER、TEXT和data,还有一个可选的ANALYSIS段。HEADER首先出现,并包含定位其他段所需的纯文本字节偏移量。TEXT段包含纯文本关键字-值对,用于描述实验、仪器、样本、数据和文件创建者希望包含的任何其他信息。DATA段以TEXT段中指定的几种格式之一包含实际的FCM数据。ANALYSIS段包含纯文本关键字-值对,用于描述用户指定的数据分析。 The proposed changes in FCS3.0 include: a mechanism for handling data sets of 100 megabytes and larger, support for UNICODE text for keyword values, support for cyclic redundancy check (CRC) validation for each data set, a requirement for the inclusion of information describing the method of signal amplification and increased support for the inclusion of time as a measurement parameter.

介绍

流式细胞术数据文件标准的目标是促进以标准化格式读取和写入流式细胞术数据文件的软件开发。标准文件格式的应用允许在一种类型的仪器上创建的文件被在不同计算机上实现的软件读取和分析。最初的FCS标准于1984年发布为FCS1.0(1),并于1990年修订为FCS2.0(2)。

FCS3.0中所包含的变化是由于微机技术、计算机通信、仪器设计和实验复杂性的快速发展所必需的。这些技术进步导致了平均数据文件大小的增加,超过了以前FCS版本设计的每个数据集99,999,999字节的限制。FCS3.0提供了一种机制来避免这种限制,同时对那些不超过100兆字节限制的数据文件保持向后兼容性。计算机网络的发展导致了大量数据在计算机之间的日常移动。这就需要一种确认文件完整性的方法。因此,FCS3.0支持在每个FCS3.0数据集的末尾放置一个循环冗余校验(CRC)字。使用CRC检查字可以检测到文件传输或读取过程中发生的错误。时间越来越多地被用作衡量参数。因此,增加了关键字支持,以更好地描述时间的获取。在流式细胞术领域的国际化引起了在关键字值中加入国际字符的需求。 Therefore, a provision has been made to support the use of multi-byte characters for some strings by providing a keyword to support the UNICODE character set (3).

目录

1.一般
1.1范围
1.2一致性
2.术语和一般要求
2.1约定
2.2定义
2.3基本概念
3.文件部分
3.1头段
3.2文本段
3.3数据段
3.4分析段
3.5 CRC值
3.6其他细分市场
4.参考文献
5.附录
5.1附录A -与FCS2.0的区别
5.2附录B -数据文件标准委员会成员
5.3附录C -建议用于读写FCS文件的API


1.一般

1.1范围

这是流式细胞术数据文件标准(FCS3.0)的3.0版。它的目的是为在细胞仪上获取数据并将数据写入文件所产生的数据集的结构提供详细的规范。

1.2一致性

为了符合FCS3.0,数据文件必须符合本文档中描述的文件结构,并且必须在文件的主文本段中包含所有必需的关键字-值对。一个符合规范的文件不能包含数据集HEADER段中没有描述的其他段。为了符合FCS3.0,分析程序必须能够正确地读取和解释包含在任何最低FCS3.0符合文件中的所有数据(最低FCS3.0符合文件是一个只有文件的TEXT段中所需的关键字-值对,而在analysis段中没有信息)。

2.术语和一般要求

2.1约定

在整个FCS3.0文件中,ASCII字符代码用于所有关键字和大多数关键字值(关于UNICODE字符的使用,请参阅3.2.20节)。

2.1.2除非另有规定,数值以10为基数。

2.2定义

2.2.1 FCS3.0数据文件由一个或多个数据集组成。

2.2.2数据集定义为细胞仪在对一定数量的颗粒进行测量时所产生的信息的集合。

2.2.3数据集中的信息集合至少分为四个段,包括HEADER段、primary TEXT段、data段和ANALYSIS段。ANALYSIS段可以是空的,任何实现者定义的段都可以在前四个段之后。FCS3.0新增了一个可选的补充文本段。

HEADER段将数据集标识为FCS3.0,并包含从数据集的开始到每个其他段的开始和结束的ASCII字节偏移量。

2.2.5关键字是数据字段的标签。关键字-值对是数据字段及其关联值的标签。

2.2.6 TEXT段包含一系列ASCII关键字-值对,描述了DATA段的格式和大部分实验操作条件。主TEXT段包含所有必需的关键字-值对。补充的TEXT段只包含可选的关键字-值对。

2.2.7 DATA段包含事件列表或数据直方图。

2.2.8事件是一个粒子的流式细胞仪测量的有序列表。事件的长度是测量中涉及的参数的数量。

2.2.9参数是细胞仪的一个检测器产生的信号。前向散射是典型的测量参数之一。参数值是参数的数字表示形式。

2.2.10数据文件中的每个数据集包含读取和解释该数据集所需的全部信息。

2.2.11文件中所有不包含在HEADER中指定的段中的空格必须用空格字符(ASCII 32)填充。这包括一个段的结束和下一个段的开始之间以及上一个数据集的结束和文件的结束之间的未使用的空间。

2.2.12列表方式数据存储是指事件依次存储在列表中。

2.2.13所有字节偏移量都引用到数据集的开头。文件中的第一个数据集从文件的字节0开始。

2.2.14实现者是创建读写FCS符合数据文件的软件的实体。

2.2.15“分隔符”是主TEXT段的第一个字符,随后被放置在主TEXT段、补充TEXT段和ANALYSIS段中,以将关键字与关键字值分开。分隔符可以是任何ASCII字符。

2.3基本概念

一个FCS3.0文件由一个或多个数据集组成,每个数据集至少包含HEADER、TEXT和data段。HEADER、TEXT和ANALYSIS段包含文本编辑器可读的ascii编码文本(一些关键字-值可能包含UNICODE字符;参见3.2.20)。DATA段包含以列表模式或直方图存储的流式细胞术数据。

3.文件部分

3.1头段

3.1.1 HEADER段的主要目的是描述其他段在数据集中的位置。HEADER段从数据集开始的字节偏移量零处开始。HEADER段的前六个字节包含版本标识符(FCS3.0)。注意,标识符中的FCS和3.0之间没有空格。接下来的4个字节(6 - 9)由空格字符(ASCII 32)占据。标识符后面是至少三对ascii编码的整数,分别表示主TEXT段、DATA段和ANALYSIS段的开始和结束的字节偏移量。字节偏移量被引用到数据集的开头。在FCS3.0下,这些偏移量仍然限制在8字节。每个ASCII编码的整数偏移量在其8字节空间中是正确的。第一个字节偏移量(字节10 - 17)是到主TEXT段开始的偏移量。 The next byte offset (bytes 18 - 25) is that for the end of the primary TEXT segment. The next offset (bytes 26 - 33) is that for the start of the DATA segment. The byte offset for the end of the DATA segment occupies bytes 34 - 41. That for the start of the ANALYSIS segment occupies bytes 42 - 49. The byte offset for the end of the ANALYSIS segment is in bytes 50 - 57. If there is no ANALYSIS segment these last two byte offsets can be set to zero (right justified) or left blank (filled with space characters). Offsets to the start and end of user-defined OTHER segments of the data set follow the ANALYSIS segment offsets. The user-defined segments will not be interpretable by others unless appropriate information is passed on by the data set originator.

与以前的FCS版本相比,一个主要的变化是允许数据集大于99,999,999字节。当段的任何部分超出99,999,999字节限制时,` 0在HEADER中被替换为段的开始和结束字节偏移量。begin DATA, end DATA, begin ANALYSIS, end ANALYSIS(如果合适的话,begin和end supplementary TEXT)的字节偏移量只能作为关键字-值对在主TEXT段中找到。注意,当一个段完全包含在一个数据集的前99,999,999个字节内时,该段的字节偏移量将作为关键字值在TEXT段中复制。还要注意,如果HEADER中的ANALYSIS偏移量为零,则必须检查$BEGINANALYSIS和$ENDANALYSIS关键字,以确定是否存在ANALYSIS段。

表1。HEADER字段的内容和字节偏移到每个字段的开头和结尾。每个偏移量在其字段中都是正确的。

开始字节和结束字节的位置

Fcs3.0 00 - 05

ASCII(32) -空格字符06 - 09

TEXT段10 - 17第一个字节的ascii编码偏移量

ascii编码的偏移到TEXT段18 - 25的最后一个字节

数据段26 - 33的第一个字节的ascii编码偏移量

数据段34 - 41的最后一个字节的ascii编码偏移量

分析段42 - 49第一个字节的ascii编码偏移量

分析段50 - 57最后一个字节的ascii编码偏移量

到用户定义的OTHER段的ascii编码偏移量58 -下一个段的开始

一个HEADER段的例子如下:


FCS3.0 * * * * * * * * * 256 * * * * 1545 * * * * 1792 * * 202456 * * * * * * * * * * * * * * 0

“*”字符在这里用来表示空格字符。TEXT段从FCS3.0中'F'的位置第256字节开始,以字节偏移量1545结束。DATA段从字节偏移量1792开始,到202456结束。没有ANALYSIS段,因此开始和结束偏移量显示为零。它们可以留白。注意HEADER段是一个连续的字节流,没有返回字符或换行字符。HEADER段的结束和下一个段的开始之间的字节必须用空格字符填充。在本例中,段的顺序为HEADER、TEXT、DATA和ANALYSIS。FCS标准只要求HEADER段位于数据集的开头,而主TEXT段完全位于前99,999,999字节内。

第二个合法HEADER段的例子是:

FCS3.0 * * * * * * * * * 256 * * * * 1545 * * * * * * * * * * * * * * 0 * * * * * * * * * * * * * * 0

开始DATA和结束DATA位置中的'0表示数据段超过了99,999,999字节限制。因此,开始数据和结束数据的字节偏移量仅位于TEXT段中的$BEGINDATA, $ENDDATA关键字值中。如果存在ANALYSIS段,begin ANALYSIS和end ANALYSIS字节偏移量也位于TEXT段的$BEGINANALYSIS和$ENDANALYSIS关键字值中。

合法HEADER段的第三个例子是:

FCS3.0 * * * * * * 202451 * * 203140 * * * * 1792 * * 202450 * * * * * * * * * * * * * * 0

这个HEADER与其他示例的不同之处在于,它描述了一个数据集,其中主TEXT段紧跟在data段之后。

3.2文本段

3.2.1 TEXT段(主段和补充段)包含一系列ASCII编码的关键字-值对,描述数据集的各个方面。例如,$TOT/5000/是一个关键字-值对,表示文件中的事件总数为5000。$TOT是关键字,5000是值。'$'字符将此关键字标记为标准FCS关键字。在本例中,'/'是分隔符。

3.2.2数据集必须包含一个主TEXT段,其中包含所有必需的关键字-值对和任意数量的可选关键字-值对。主TEXT段必须完全包含在数据集的前99,999,999字节中。

3.2.3数据集可以包含可选的补充文本段,该文本段只能包含可选的关键字-值对,并且可以放在数据集中HEADER段之后的任何位置。

3.2.4补充文本段开始和结束的字节偏移在$BEGINSTEXT和$ENDSTEXT关键字-值对中找到,它们必须位于主文本段中。

3.2.5主文本段的第一个字符是ASCII分隔符。此字符还必须用作ANALYSIS和补充TEXT段中的分隔符。

3.2.6分隔符放置在关键字值的开头和结尾。

3.2.7分隔符不能是关键字或关键字值的第一个字符。如果分隔符出现在关键字或关键字值中,则必须立即跟在第二个分隔符后面。例如,“$SYS/RSX-11//M/”显示关键字$SYS的值为RSX-11/M。由于不允许空(零长度)关键字或关键字值,因此在值和关键字之间永远不能出现两个连续的分隔符。

3.2.8所有关键字均采用ASCII编码。关键字值默认使用ASCII编码。指定关键字的值可能是使用$UNICODE关键字在ASCII中无法表示的语言。

3.2.9关键字和关键字值的长度必须大于零。

3.2.10关键字不区分大小写,文件中关键字可以用小写字母、大写字母或大小写混合书写。但是,FCS文件读取器必须忽略关键字大小写。关键字值可以是小写字母、大写字母或大小写混合。关键字值区分大小写。

3.2.11关键字没有默认值。

3.2.12 fcs定义的关键字必须以'$'字符开头。只有fcs定义的关键字可以以'$'字符开头。

3.2.13实现者不能重新定义fcs定义的关键字。

3.2.14 FCS关键字-值对有必选和可选两种。所需的关键字-值对表示成功读写FCS数据集所需的最小集。符合FCS文件读取程序必须识别所需的FCS关键字。

3.2.15 TEXT段不能包含return (ASCII 13)、换行(ASCII 10)或其他不可打印字符,除非它们在关键字值内或用作分隔符。

3.2.16参数描述关键字(如$PnR, $PnB等)按照参数写入文件的顺序从1开始连续编号。

下面列出了必需的和可选的FCS关键字,并附有一行描述。关键字和它们的值在列表后面按字母顺序描述。所需的关键字就是这样指示的。

3.2.18所需的FCS主TEXT段关键字如下:

$BEGINANALYSIS分析段开始的字节偏移量。

$BEGINDATA到DATA段开始的字节偏移量。

$BEGINSTEXT补充文本段开始的字节偏移量。

数据采集计算机的字节顺序。

$DATATYPE data段的数据类型(ASCII,整数,浮点数)。

$ENDANALYSIS到ANALYSIS段结束的字节偏移量。

$ENDDATA到DATA段结尾的字节偏移量。

$ENDSTEXT补充文本段结束的字节偏移量。

数据模式(列表模式,直方图)。

$NEXTDATA文件中下一个数据集的字节偏移量。

$PAR事件中的参数个数。

$PnB参数号n的预留位数。

参数n的放大类型。

$PnR参数编号n的范围。

$TOT数据集中的事件总数。

3.2.19可选的FCS TEXT段关键字如下:

$ABRT事件丢失由于数据获取电子巧合。

$BTIM数据采集开始时的时钟时间。

$CELLS测量对象的描述。

COM美元发表评论。

荧光补偿矩阵。

$CSMODE单元格子集模式,一个对象可能属于的子集数目。

用于编码单元格子集标识符的比特数。

$CSVnFLAG为子集n设置的标志位。

$CYT流式细胞仪的类型。

$CYTSN流式细胞仪序列号。

$DATE数据集获取日期。

$ETIM数据采集结束时的时钟时间。

$EXP开始实验的研究者姓名。

$FIL包含该数据集的数据文件名称。

$GATE门控参数个数。

$GATING用于门控的区域组合。

门控参数n的放大类型。

$GnF用于门控参数n的光学滤波器。

$GnN门控参数编号n的名称。

通过门控参数n收集的发射光的百分比。

$GnR门控参数n的范围。

$GnS用于门控参数n的名称。

门控参数n的检测器类型。

门控参数n的检测器电压。

获取数据的机构。

$LOST由于计算机繁忙而丢失的事件数。

$OP流式细胞仪操作员名称。

参数n的单变量直方图峰值通道数。

参数n的单变量直方图峰值通道数。

$PnF参数n的滤光片名称。

参数n采集所用的放大器增益。

参数n的激发波长。

$PnN参数n的缩写。

参数n的激励功率。

参数n收集到的发射光的百分比。

$PnS参数n的名称。

参数n的检测器类型。

参数n的检测器电压。

$PROJ实验项目名称。

参数编号n的门控区域。

门控区域n的窗口设置。

样品(管或井)标签。

$SRC样本来源(患者姓名,细胞类型)

$SYS计算机类型及其操作系统。

$TIMESTEP Time参数的时间步长。

$TR触发参数及其阈值。

字符串类型关键字值的UNICODE代码页。

3.2.20关键字的字母顺序列表和详细描述。对于'n'以下的所有关键字,'n1', 'n2'等表示ascii编码的整数值。字符“f”表示ascii编码的浮点数。单词“string”表示ASCII或unicode编码的TEXT字符串,其长度可以大于零。如果使用可选的$UNICODE关键字,则字符串的指定子集可以用多种符合UNICODE的语言中的两个字节字符表示。否则字符串是单字节ASCII。字符“c”表示单个ascii编码字符。这里使用'/'字符作为分隔符,用于说明目的。

ABRT / n / ABRT美元/ 1265 /

由于数据采集电子巧合效应而丢失的事件数。这里中止的事件数为1265。

$BEGINANALYSIS/n/ $BEGINANALYSIS/123456789/ [REQUIRED]

该字段包含从数据集开始到可选ANALYSIS段开始的字节偏移量。如果没有ANALYSIS段,在这个关键字值中应该放置一个“0”。在本例中,ANALYSIS段从字节123,456,789开始。

$BEGINDATA/n/ $BEGINDATA/123456789/ [REQUIRED]

该字段包含从数据集开始到data段开始的字节偏移量。如果数据段完全包含在数据集的前99,999,999字节内,则此值与HEADER段中包含的偏移量相同。在本例中,DATA段从字节123,456,789开始

$BEGINSTEXT/n/ $BEGINSTEXT/123456789/ [REQUIRED]

该字段包含从数据集开始到补充TEXT段开始的字节偏移量。如果没有补充的TEXT段,则该值应设置为“0”。在本例中,补充的TEXT段从字节123,456,789开始。

$ BTIM / hh: mm: ss (tt) / $ BTIM / 14:22:10:47 /

时钟时间开始数据采集。格式为24小时时钟小时:分钟:秒:小数秒数,单位为1/60秒。小数秒[:tt]是可选的。数据采集开始于14小时22分10秒47/60秒。

$BYTEORD/n1,n2,n3,n4/ $BYTEORD/4,3,2,1/ [REQUIRED]

该关键字指定从数字最不重要的[1]到数字最重要的[4]的顺序,其中四个二进制数据字节写入数据采集计算机中组成一个32位字。数字之间用逗号分隔(ASCII 44)。在VAX计算机和IBM PC类型的个人计算机中,字节顺序是1,2,3,4,最不重要的字节先写。在Hewlett Packard、Macintosh和Sun计算机中,字节顺序是4,3,2,1,这意味着最低有效的字节是最后写入的。在PDP-11计算机中,字节顺序是3、4、1、2,这意味着在组成一个32位字的两个16位字中,最重要的16位字先写。然而,在16位字中,最不重要的字节首先被写入,这与PC相同。字节顺序在参考文献4中进行了更全面的讨论。在本例中,最重要的字节首先写入,最不重要的字节最后写入。使用此关键字可以收集一种计算机类型上的数据并分析另一种计算机类型上的数据。

$CELLS/string/ $CELLS/正常人类外周血/

测量的单元格或其他对象的类型。这个标本是正常的人类外周血。

孵化时间为47分钟

此关键字用于将注释附加到数据集。它不应该被用来代替其他标准的关键字。的使用COM美元向数据集中添加一个简短的注释,否则可能只出现在实验室笔记本上的注释。

$ COMP / n, f1, f2, f3,……/ COMP / 3美元,0.0,-0.1,0.0,-40.0,0.0,-0.6,0.0,-36.4,0.0 /

该关键字能够有效地存储荧光补偿矩阵。矩阵有n行n列,其中n表示采集参数的个数。f1, f2,

f3,……表示矩阵元素的浮点数。正负值都是允许的。正的或无符号的值表示补偿是加的,而负的值表示更常见的情况是减法补偿。元素以行为主的顺序存储,也就是说,第一行的元素先出现。矩阵元素Cij是从FLi中电子减去FLj的百分比。在本例中,补偿矩阵为3 × 3,矩阵元素的减法值为:C11=0.0%, C12 = 0.1%, C13 =0.0%, C21 = 40.0%, C22=0.0%, C23 = 0.6%, C31 =0.0%, C32 = 36.4%, C33 =0.0%。

CSMODE / n / CSMODE / 3美元/

单元格子集模式,即一个对象可能属于的子集的“n”个数。最简单的情况是,单元格子集参数为每个对象编码一个值,如n = 1所示。如果n的值大于1,则表示单元格子集参数的值可以编码n个子集标识符。在这些情况下,CSVBITS美元而且CSVnFLAG美元关键字值将指定如何编码单元格子集值。应该注意的是,无论这个关键字的值是多少,单元格子集值为0表示所使用的分析方案未定义对象。

CSVBITS / n / CSVBITS / 4美元/

用于编码单元格子集值的比特数。当CSMODE美元关键字值大于1时,用于编码单元格子集标识符的比特数必须由CSVBITS美元关键字的值。在引用的示例中,4位,即0-15的值,用于编码单元格子集标识符。请参阅第3.4节中对ANALYSIS部分的讨论。

CSVnFLAG CSV1FLAG / 4096 /美元

用作“标志”的值,表示“n”标识符字段编码一个值。在引用的示例中,如果在单元格子集参数的值中设置了第13位(参数值AND 8192为TRUE),则应该读取比特的第二个字段来解码该值。不需要设置“flags”,但如果希望使用0对任何字段的第一个子集进行编码,则必须设置“flag”以指示该字段中的0指的是一个子集。请参阅第3.4节中对ANALYSIS部分的讨论。

CYT /字符串/ CYT美元/ FACScan /

用于数据集的流式细胞仪的名称。这里使用了FACScan。

CYTSN /字符串/ CYTSN / 400美元e370 /

用于数据集的流式细胞仪的序列号。这里的序列号是400E370。

$DATATYPE/c/ $DATATYPE/I/[必填]

该关键字描述了写入数据集data段的数据类型。四个允许的值是“I”、“F”、“D”或“A”。DATA段是一个连续的位流,没有分隔符。'I'代表无符号二进制整数,F代表单精度IEEE浮点数,'D'代表双精度IEEE浮点数,'A'代表ASCII。附加的关键字PnB美元(每个参数的位数)和美元的内线(每个参数的范围)需要完整地描述DATA段中的事件。

数据类型/我/美元表示事件被写成无符号二进制整数。对于事件中的每个参数,都需要为存储参数分配的最大比特长度和参数在该分配中使用的实际整数范围。每个参数的比特数由PnB美元.例如,P1B / 16美元为参数1分配16位。P1R / 1024 /美元指定参数1的值范围为0到1023。这允许指定数据字长,促进具有不同数据字长的机器之间的兼容性,并支持数据的位压缩。

数据类型/ F /美元意味着数据被写入IEEE标准格式的单精度浮点值。注意PnB美元对于事件中的每个参数,关键字应该设置为32。例如,P1B / 32美元

数据类型/ D /美元意味着数据被写入IEEE标准格式的双精度浮点值。的PnB美元关键字应该为事件中的每个参数设置为64的值。例如,P3B / 64 /美元表示参数3被分配64位的存储空间。IEEE单精度和双精度数的标准格式如下表所示:

单精度双精度

符号位31位63

指数位30-23位62-52

偏差127偏差1023

分数位22-0位51-0

范围3.402823e+38 1.797693e+308

约。1.175494 38吗2.225074 e - 308

数据类型/ /意味着数据被写入ascii编码的整数值。在本例中,是关键字PnB美元指定为每个值分配的字节数(每个字符一个字节)。这表示固定格式的ASCII数据。P1B / 4美元/指示参数1的最大值为9999。数据存储在连续的字节流中,没有分隔符。的值PnB美元关键字是*字符,例如:美元P1B / * /,数据为自由格式,每个参数值的字符数可能会有所不同。在这种情况下,所有值都由以下分隔符之一分隔:“空格”、“制表符”、“逗号”、“回车”或“换行”字符。注意,多个连续的分隔符被视为单个分隔符。由于不同编程语言处理连续分隔符的方式存在显著差异,因此在使用此格式时应格外小心。零值必须由Zero(0)字符显式指定。因此,字符串“1,3,,,3”(注意第三和第四个逗号之间的空格)将只指定三个值。对于不同的编程语言,它将被视为3到5个值。

日期/ dd-mmm-yyyy美元/日期/ 01 - 10月- 1994美元

此关键字指定创建数据集的日期。格式为day-month-year,字符数为dd-mm -yyyy。该数据集创建于1994年10月1日。注意,所有字符的位置都应该填充,包括前导零。接受的月份缩写是:JAN, FEB, MAR, APR, MAY, JUN, JUL, AUG, SEP, OCT, NOV, DEC。

$ENDANALYSIS/n/ $ENDANALYSIS/123456789/ [REQUIRED]

该字段包含从数据集开始到ANALYSIS段结束的字节偏移量。如果没有ANALYSIS段,在这个关键字值中应该放置一个“0”。在本例中,ANALYSIS段在字节123,456,789处结束

$ENDDATA/n/ $ENDDATA/123456789/ [REQUIRED]

该字段包含从数据集开始到data段结束的字节偏移量。如果数据段完全包含在数据集的前99,999,999字节中,则此值与HEADER段中包含的偏移量相同。在本例中,DATA段结束于字节123,456,789。

ENDSTEXT / n / ENDSTEXT美元/ 123456789 /(需要)

该字段包含从数据集开始到补充TEXT段结束的字节偏移量。如果没有补充的TEXT段,则该值应设置为“0”。在本例中,补充的TEXT段结束于字节123,456,789。

东伊运美元/ hh: mm: ss (tt):美元/东伊运/ 14:22:10:47 /

时钟时间在数据采集结束。格式为24小时时钟小时:分钟:秒:小数秒数,单位为1/60秒。数据采集结束于14小时22分10秒47/60秒。分数秒关键字值是可选的,由方括号表示。

EXP /字符串/经验/美元。史密斯/

发起实验的人的名字。这个实验是在史密斯的指导下进行的。

费尔/字符串/费尔美元/ 071494.001 /

与此数据集对应的数据文件的名称。如果FCS文件中只有一个数据集,那么这个文件名应该与FCS文件的名称相同。如果此数据集是FCS文件中的多个数据集之一,则文件名可能对应于某个较早时间收集的数据文件。在本例中,数据存储在名为071494.001的文件中。

门/ n /门/ 2美元/

此关键字指定用于浇注的参数数量。它类似于美元票面价值关键字,它指定数据集中每个事件的参数总数。在本例中,有两个门控参数。目前在许多流式细胞仪实验室的做法是,收集门控参数作为数据集的一部分。这一事实反映在重新定义RnI美元关键字描述如下。

$GATING/字符串/ $GATING/R1/ $GATING/R1和(r2.0 . r . r3)/

此关键字指定在何种条件下获取数据集中的数据。属性在下面定义的区域之间通过布尔运算设置条件RnI美元和$RnW关键词。允许的布尔运算符有AND、OR(包括)和NOT。操作数是区域Rn。操作符与操作数或其他操作符之间用空格或句点分隔。运算符优先级从左到右,除非用括号覆盖。在第一个示例中,使用门控区域R1收集数据。参数值落在R1之外的事件被排除在数据集中。在第二个例子中,只有当适当的参数值在R1和R2或R3中,或两者都在时,事件才包含在数据集中。

带有美元/ f1, f2 / G3E / 4.0美元,0.01 /

这个关键字指定是线性放大器还是对数放大器用于门控参数数n。当放大为对数时,f1的值指定对数几十年的数量,f2表示对数值为0的信号将获得的线性值。在上面的例子中,参数3的数据是使用40年对数放大器收集的,0通道表示线性值0.01。当使用线性放大或放大未定义时,例如使用一些计算参数时,f1和f2被设置为0。

GnF /字符串/ G2F美元/ 520 / lp

这个关键字指定了用于到达检测器的门控参数n的光的光学滤光片。这个例子表明用于第二个门控参数的光学滤光片是520nm型长通。

GnN /字符串/ G1N美元/ FL2 /

这个关键字指定了门控参数编号n的缩写。这里“FL2”是门控参数1的名称。参数的短名称如下:

FS正向散射

SS侧散射

荧光通道n

轴向消光

CV容量

时间时间

国民生产总值/ n1 / P3P / 27美元

检测器为门控参数数字n1收集的光量,表示为荧光物体发出的光的百分比。在示例中,27%的发射光被检测器捕获,用于门控参数3。

GnR / n1 / G2R美元/ 1024 /

该关键字指定了门控参数n的范围n1。本例中,门控参数2的事件范围为0 ~ 1023。

GnS /字符串/ g1 / FITC-CD45 /美元

该关键字为门控参数n指定了比允许的更长的名称GnN美元.这里,fitc标记的CD45是门控参数1的名称。

因/字符串/ G2T美元/ PMT9524 /

这个关键字指定了门控参数n的检测器类型。这里,门控参数2使用了9524型光电倍增管(PMT)。

GnV / n1 / G2V类恒星美元/ 645 /

该关键字指定了门控参数n的检测器偏置电压。本例中,门控参数2的检测器偏置电压为645伏。

$INST/string/ $INST/ FCM实验室,RPCI/

收集数据的机构或实验室。在本例中,数据收集于Roswell Park癌症研究所的流式细胞仪实验室。

失去了/ n /美元/ 457 /损失

此关键字指定在数据采集期间由于计算机忙于其他任务而丢失的事件数。在这里,457个事件被完全遗忘了。

$MODE/c/ $MODE/L/[必选]

该关键字指定获取数据的模式。字符c允许的值是' c ', 'L',或'U'。这些选项的说明如下:

C一个相关的多元直方图以多维数组的形式存储在数据集中。每个数据集只能有一个这样的直方图。在存储多参数相关数据时,第一个参数的索引先递增,然后是第二个,以此类推。对于双变量数据,第一个数据值对应参数1的指标1,参数2的指标1,第二个数据值对应参数1的指标2,参数2的指标1,以此类推。

L列表模式。对于每个事件,每个参数的值按照描述参数的顺序存储。参数1保留的比特数使用P1B美元关键字。每个数据集只能有一组列表模式数据。的元数据类型关键字用于描述数据格式。这是最通用的流式细胞术数据存储模式,因为C模式和U模式数据可以从L模式数据创建。

U不相关单变量直方图。每个数据集可以有多个单变量直方图。参数1的直方图频率首先存储,然后是参数2的直方图频率,等等。如果单变量直方图已被门控,则它们必须都是使用相同的门控获得的,以便每个直方图中的事件总数相同。

$NEXTDATA/n/ $NEXTDATA/202512/ [REQUIRED]

当一个FCS文件中有多个数据集时,这个关键字给出了从一个数据集的开始到FCS文件中下一个数据集HEADER中的第一个字节的字节偏移量。如果n为零(0),则这是文件中最后的或唯一的数据集。此示例显示下一个数据集从当前数据集开始的字节202512开始。每个数据集都是独立的,必须包含完整的关键字。

OP /字符串/ OP /戴夫/美元

流式细胞仪操作人员的名称。戴夫是这个仪器的操作员。

$PAR/n/ $PAR/5/[必需]

此关键字指定存储在数据集中每个事件中的参数总数。在本例中,为每个事件存储了五个参数的数据。

波兰/ n1 / PK2/374 /美元

对于参数n的单变量直方图,此关键字指定包含事件最高频率的通道号n1。在本例中,参数2的单变量直方图中的峰值位于通道374。的PKNn美元关键字指定该通道中的计数。

PKNn / n1 / PKN2/12803 /美元

对于参数n的单变量直方图,此关键字指定包含最大事件频率的通道号(直方图库)中的事件数量n1。在本例中,参数2的单变量直方图的最大事件频率为12803。的波兰美元上面的关键字指定此峰值计数发生在通道374。

$PnB/n1/ $P3B/16/[必需]

美元的价格数据类型/我/(二进制整数),此关键字指定分配的位数n1,用于存储参数n。在本例中,参数3的数据值将存储为两个字节(16位)。此关键字与美元的内线来确定数据实际是如何存储的。一台带有10位模数转换器(adc)的流式细胞仪就可以的内线/ 1024 /美元。一个10位的数字将存储在分配的16位空间PnB / 16美元每个参数留6位空。这些关键字可以对事件进行紧密的位打包。例如,数据存储可以指定为PnB / 10美元的内线/ 1024 /对于事件中的n个参数中的每一个。这样在存储每个事件时就会浪费更少的比特。但是,将这些数据打包存储,然后将其解压缩进行分析非常耗时。在实践中,大多数流式细胞仪使用PnB / 16美元的内线/ 1024 /用于10位数据。使用8位adc的流式细胞仪PnB / 8美元的内线/ 256 /其中n表示从1到测量参数数的整数。

数据类型/ /美元(ascii编码整数),PnB美元为参数n的每个测量值指定字符数n。

$PnE/f1,f2/ $P3E/4.0,0.01/[要求

该关键字指定参数n使用的是线性放大器还是对数放大器。当放大为对数时,f1的值指定对数几十年的数量,f2表示对数值为0的信号将获得的线性值。在上面的例子中,参数3的数据是使用40年对数放大器收集的,0通道表示线性值0.01。当使用线性放大或放大未定义时,例如使用一些计算参数时,f1和f2被设置为0。

PnF /字符串/虽然P2F美元/ 520 / lp

这个关键字指定了用于参数n的光到达探测器的光学滤光片。这个例子表明用于第二个参数的光学滤光片是520nm型长通。

PnG / f / P2G美元/ 10.0 /

这个关键字指定用于放大参数n的信号的增益。这个例子表明参数2在数字化之前被放大了10.0倍。

美元/ n1 / P1L美元/ 488 /

该关键字指定参数n的激发波长n1,单位为nm。在本例中,参数1的波长为488 nm。

并通过/字符串/ P3N美元/ FL1 /

该关键字用于指定参数n的简称。这里参数3的简称为FL1。参数的短名称如下:

CS细胞子集

FS正向散射

SS侧散射

荧光通道n

轴向消光

CV容量

时间时间

PnO / n1 / P2O美元/ 200 /

这个关键字指定了与参数n的测量相关联的光源的激发功率n1,单位为毫瓦。这里使用200mw来产生与参数2相关的信号。

PnP / n1 / P4P / 50美元

探测器为参数数n收集的光量,表示为荧光物体发出的光的百分比。在这个例子中,50%的发射光被参数4的探测器捕获。

$PnR/n1/ $P2R/1024/[必需]

该关键字指定参数n的最大范围n1模式/ L /美元(列表模式数据),这对应的ADC范围,这里是1024。取值范围为0 ~ 1023。对于单变量直方图数据(模式/ C /美元模式/ U /美元),为参数n直方图中的通道数n1。这里直方图的通道数范围为0 ~ 1023。

$PnS/string/ $PnS/CD45 FITC Fluorescence/

这个关键字指定了一个长名称,用于在参数n的图中作为轴标签。在这里,fitc标记的CD45是标签。pn美元长名字是否等同于并通过美元

PnT /字符串/ P2T美元/ PMT9524 /

该关键字指定参数n的检测器类型。这里,参数2使用9524型光电倍增管(PMT)。

巴斯克民族主义党/ n1 / pv2美元/ 645 /

该关键字指定参数n的检测器偏置电压n1,单位为伏特。在本例中,参数2的检测器偏置电压为645伏特。

$PROJ/字符串/ $PROJ/AML患者研究/

这个关键字提供了项目的名称。这是一个AML患者的研究。

$RnI/string1,[string2]/ $R3I/P2,P4/ $R2I/G3/

这个关键字将门控区域号n与一个或两个参数相关联,这里显示为string1和string2。这两个字符串的形式是“Pn”或“Gn”。“Pn”代表收集的参数n,而“Gn”代表门控参数n。在第一个例子中,门控区域3与参数2和参数4的二元点图或二元直方图相关联。的RnW美元下面描述的关键字指定浇注区域的形状。在第二个示例中,门控区域2与门控参数3相关联。的讨论部分美元的门关键字。

$RnW/n1, n2[;n3, n4;…]/ $ r1w / 35,366 /

此关键字指定为门控区域n的窗口设置。此窗口设置仅在RnI美元关键字也指定了。如果关键字RnI美元只有一个值,则n1和n2指定单变量直方图中窗口的包含下界和上界。例如,R2I / 3 / R2W美元/ 345366 /指定门控区域2与门控参数3关联。门控事件的范围必须在通道345和366之间(包括通道345和366)。如果RnI美元关键字值有两个值,则该窗口存在于二元图中,并且在RnW美元关键字作为一个多边形。多边形中第一个点的x坐标和y坐标是n1, n2对。下一个点由';'字符与第一个点分开,并表示为上面的n3, n4。多边形可以包含用分号分隔的任意数量的点。假设第一点和最后一点是相连的。例如,R1I / 2美元,3 / R1W美元/ 310205;515304;480615;240514;354542 /指定区域1在参数2和3中定义,并且区域1窗口在这个2参数空间中是一个5边多边形。的美元的控制关键字将指定窗口的使用方式(AND, OR等)。

SMNO /字符串/ SMN0美元/ A7 /

该关键字指定了样本编号,可以是管号或井号。这里的标本号是A7。

SRC /字符串/ SRC /美元J。无名氏,HIV阳性患者

这个关键字指定了样本的来源。请注意,此关键字值可能包含受美国隐私法案和严格的美国国立卫生研究院指南保护的患者信息。获取实验室可以选择对该关键字值使用编码信息。

$SYS/string/ $SYS/Macintosh System 7.5/

此关键字指定收集数据集的计算机类型和操作系统。这里的数据集是在运行System 7.5的Macintosh上收集的。

$TIMESTEP/f/ $TIMESTEP/0.0167/ $TIMESTEP/1.0/

此关键字的存在表明时间已被收集为数据集中的参数之一。并通过美元/时间/指定哪个参数表示时间。美元的步伐以秒为单位指定时间步长。在第一个示例中,时间步长为0.0167秒,即1/60秒,是个人计算机上典型的时钟滴答声。对于本例,实现者指定P6N /时间/ P6B / 16美元/ P6R / 65536 /步伐美元/ 0.0167 /.当计算机捕获数据集中的第一个事件时,将读取自计算机打开以来的时钟滴答数,并将其保存为常数n滴答。在第一个事件中,参数6输入零值。当第二个事件到达时,从计算机时钟获得时钟滴答数。n从该数字减去Ticks,结果存储为第二个事件的参数6。参数6值乘以第一个事件之间的实际秒数美元的步伐价值。在本例中,最大时间范围约为17.5分钟。在第二个例子中,实现者指定P6N /时间/ P6B / 16美元/ P6R / 65536 /步伐美元/ 1.0 /.使用与第一个例子中相同的过程,在第一个事件之后不到1.0秒到达的任何事件的参数值为0,而在1.0秒到(小于)2.0秒之间到达的事件的参数6值为1。最大时间范围约为18小时。如果使用外部常数时间间隔发生器来提供随时间线性增加的信号输入,则适当的TEXT关键字可能是P6N /时间/ P6B / 16美元/ P6R美元/ 1024 /

步伐美元/ 0.001 /.这里的时间步长比计算机时钟的时间步长要小。然而,步数受到ADC范围的限制,这里是10位。本例中的最大时间范围是1023秒。

$TOT/n/ $TOT/25000/[必选]

此关键字指定数据集中事件的总数。该数据集包含25000个事件。

$TR/string, n/ $TR/FS,54/

此关键字指定作为事件触发信号的参数名称。数字n是表示事件的阈值的通道号。当超过阈值时,将声明一个事件。这里前向散射(FS)是触发信号,事件阈值位于通道54。

$ UNICODE / n string1 string2相等等/ UNICODE / 3美元,SYS, SRC /美元

整数“n”表示使用的UNICODE页码,逗号分隔的字符串表示使用UNICODE文本的关键字值。UNICODE是一种国际标准,使计算机能够表示世界上大多数语言。每种语言的字符在代码页上都表示为两字节代码。有65536个代码可用。美国ASCII码需要256个双字节字符。对于支持UNICODE的计算机系统,实现者将能够以流式细胞仪数据正在收集的国家的语言显示轴标签和其他适当的文本字符串。如果此关键字不存在,则对所有字符串使用单字节美国ASCII。在上面的示例中,使用UNICODE页3编写SYS美元而且SRC美元关键词。

3.3数据段

DATA段以三种模式之一(列表模式、相关模式或不相关模式)包含原始数据美元的模式关键字的值。类所描述的四种允许格式之一(二进制、浮点、双精度浮点或ASCII)将数据写入data段元数据类型关键字的值。最常见的数据存储形式是二进制整数形式的列表模式存储(数据类型/ I /模式/ L /美元).的PnB美元一组关键字指定存储每个参数的位宽。的美元的内线关键字集为每个参数指定通道号范围。例如,P1B / 16 / P1R美元/ 1024 /为参数1指定一个16位的字段,为参数1的值指定一个从0到1023的范围,对应10位。实现者在读取这些列表模式参数值时应该使用位掩码,以确保错误值不会从4个未使用的位中读取。

3.4分析段

ANALYSIS是一个可选的片段,当它出现时,包含数据处理的结果。通常情况下,在数据收集并存储到数据集中之后,分析是离线执行的。因此,ANALYSIS段通常包含添加到原始文件副本的信息。例如,细胞周期分析或免疫表型测定的结果往往涉及更复杂的分析,而不能在收集和存储数据时“实时”执行。ANALYSIS段与TEXT段具有相同的结构;也就是说,它由一系列关键字-值对组成。ANALYSIS段没有必要的关键字。可选的FCS关键字在3.4.1中有一行描述,在3.4.2中有完整的描述和示例。实现者可以添加他们自己的关键字。

有人建议将ANALYSIS片段用于识别细胞亚群,通过区域绘制或一些划分方法(如聚类分析)确定(4)。这可能对免疫分型数据特别有用。下面将讨论识别细胞子集的三种方法。前两种使用数据集中最少的空间,但要求单元格子集是不相连的。第三种方法为每个事件添加一个参数,并支持重叠的单元格子集赋值。

在方法1中,实现者使用TEXT段关键字-值对CSMODE美元/ 1/和CSTOT / n /美元指定有一组细胞子集包含n个不相交的细胞子集。TEXT段关键字-值对CSVBITS / 8美元用于指示每个事件的单元格子集赋值存储在无符号字符(每个8位)的二进制向量中,其长度为数据集中的事件数。这个向量存储在ANALYSIS段之后的另一个段中。DATA段包含原始数据的副本,其中事件按照与原始数据集中相同的顺序写入。在分析部分,CSnNUM美元用于计算n个子集中每个单元格的数量。

在方法2中,实现者使用TEXT段关键字-值对CSMODE美元/ 1 /而且CSTOT / n /美元如上所述但不使用CSVBITS美元关键字。在DATA段中,事件每次写入一个单元格子集,而不是按照原来的事件顺序。在分析部分,CSnNUM美元用于计算n个子集中每个单元格的数量。不需要其他分段。

方法3为数据集中的每个事件创建额外的单元格子集(CS)参数。该方法可以定义细胞子集,如聚类分析、神经网络、参数组合上的布尔门、n维空间中的超平面等。参数的值可以为每个事件编码一个子集标识符号(CSMODE美元/ 1 /)或每个事件有多个标识符编号(值为CSMODE美元的值指定标识符数字的含义CSnNAME美元关键字在文本和分析段。如果CS参数的值为0(零),则用于分配单元格子集的定义未对该事件进行分类。如果分类方案创建了独特的非重叠种群,如CD4 T细胞、CD8 T细胞、B细胞、单核/巨噬细胞、中性粒细胞等,那么最简单的方法是设置的值CSMODE美元改为“1”,使用1==CD4 T细胞,2 == CD8 T细胞等。在某些情况下,将单个单元格分配给多个已定义子集可能很有用。例如,为了扩展前面的例子,子集标识符1 - 5将上面列出的定义与6 ==淋巴细胞和7 ==单个核细胞对应。这个方案需要CSMODE / 3美元因为一个细胞可以属于三个定义的子集。操作上,假设数据集中的一个事件是CD4 T细胞,那么第一个位字段将编码值1 (CD4 T细胞),第二个位字段将编码值6(淋巴细胞),第三个位字段将编码值7(单个核细胞)。类的值定义位字段及其解释CSVBITS美元CSVnFLAG美元方法3还支持创建一个ANALYSIS段,其中包括一个结果的摘要,这些结果被写成与每个子集中单元格数量相关的关键字的值,等等。方法3有一个额外参数的大小“成本”,但它允许将分析的完整和显式记录作为数据集的一个组成部分。

3.4.1可选FCS ANALYSIS段关键字列表:

$CSDATE单元格子集分析日期。

单元格子集定义文件名。

$CSEXP执行细胞子集分析的人员名称。

$CSnName单元子集编号n的名称。

$CSnNUM编号为n的单元子集中的单元数。

3.4.2可选FCS ANALYSIS段关键词:

CSDATE / dd-mmm-yyyy CSDATE美元/ 26 - 10月- 94 /

单元格子集日期。此关键字指定创建包含单元格子集分析的数据集的日期。日期的格式与for的格式相同美元的日期.这个数据集是1994年10月26日创建的。

CSDEFFILE /字符串/ CSDEFFILE美元/ c: \ filename.dat /

单元格子集定义文件。字符串是包含定义每个单元格子集所需信息的文件的名称。在本例中,单元格子集定义文件名为filename.dat,位于c:驱动器上。

CSEXP /字符串/ CSEXP /美元。史密斯/

细胞子集实验者。进行细胞子集分析的人员的姓名。在这里,A. Smith进行了细胞子集分析。

CSnName /字符串/ CS2N美元/淋巴细胞/

单元格子集名称。这是一个命名细胞子集编号n的字符串。在本例中,细胞子集2命名为“淋巴细胞”。

CSnNUM / n1 / CS2NUM美元/ 3456 /

这个关键字指定了单元格子集编号n中的单元格数量n1。在本例中,单元格子集2包含3456个单元格。

3.5 CRC值

CRC字是为每个数据集的部分计算的,从HEADER段的第一个字节开始,到数据集的最后一个段的最后一个字节结束(可以是TEXT, data, ANALYSIS或OTHER段)。CRC字是一个16位循环冗余校验值(5)。这个16位CRC字符合CCITT标准(Comite' Consultatif International Te'le'graphique et Te'le'phonique)。该标准使用CCITT多项式X16 + X12 + X5,并要求每个输入字符都被解释为其位反转图像。如果最后两个函数参数分别为0和-1,那么参考文献6中的icrc函数就满足了这些要求。CRC值将以ASCII的形式放置在紧邻结束数据集的8个字节中。如果实现者选择不计算和存储CRC字,则数据集结束后的8个字节应该用ASCII '0'字符填充。

3.6其他细分市场

实现者可以根据自己的选择创建任意数量的OTHER段。

4.参考文献

1.Murphy RF, Chused TM:流式细胞术数据文件标准的建议。细胞检测技术:553-555,1984。

2.Dean PN, Bagwell CB, Lindmo T, Murphy RF和Salzman GC:流式细胞仪数据文件标准。细胞检测技术11:323-332,1990。

3.统一码联盟:统一码标准,1.0版,第1卷。Addison-Wesley出版公司,Reading, MA, 1991。

4.Redelman D, Coder DM:细胞子集(Cell子集,CS)参数,用于记录流式细胞术数据中单个细胞的身份。细胞计数术,1994。

5.特科尔斯基SA、维特林WT、弗兰纳里BP:《数字食谱C. 2版》,剑桥大学出版社,英国剑桥,1992年。

5.1附录A FCS2.0与FCS3.0的主要区别

1) HEADER已被修改,以容纳超过99,999,999字节的数据集。任何需要超过8个字节的偏移值现在都通过在HEADER中为该值及其相关的“$BEGIN”值放置一个“0”来表示。然后在数据集的主TEXT段中找到实际的字节偏移值。该系统允许绝大多数数据文件向后兼容为以前的FCS版本设计的分析软件。然而,HEADER中的'0'字节偏移量将阻止先前的FCS版本读取非常大的数据集,避免读取错误或部分数据读取。注意,在符合FCS3.0的文件的HEADER段中,$BEGINDATA, $ENDDATA, $BEGINANALYSIS, $ENDANALYSIS, $BIGINSTEXT和$ENDSTEXT关键字-值对是必需的,与数据集的大小无关。当数据集的大小仍然低于100兆字节限制时,字节偏移量将在HEADER和主TEXT段的关键字值对中找到。当数据集达到或超过100兆字节时,字节偏移量将只位于主TEXT段中。

2)一个补充的TEXT段现在可以包含在一个数据集中。补充的TEXT段可以只包含可选的关键字-值对,并且可以位于数据集中HEADER段之后的任何位置。

3)主TEXT段必须包含所有必需的关键字-值对,并且完全位于数据集的前99,999,999字节内。

4)在每个数据集的末尾增加了一个可选的16位CRC校验。这个内部检查字允许数据集完整性检查。

5)为了使第三方或离线分析软件能够正确读取和解释数据,现在每个参数都需要关键字$PnE。关键字$PnE描述了用于给定参数的放大方法。

6)有一些新的可选的FCS文本段关键字。$CSMODE, $CSTOT, $CSVBITS, $CSVnFLAG指定一个附加参数来标识单元格子集。$CYTSN指定细胞仪序列号。$RnI已被重新定义。已添加$TIMESTEP以允许使用时间参数。$UNICODE允许使用ASCII文本无法表示的语言指定某些关键字。

7)年份的$DATE关键字值增加了两个字节到-yyyy。

8)添加以下可选的ANALYSIS段关键字:$CSDATE, CSDEFFILE, $CSEXP, $CSnN, $CSnNUM,以启用单元格子集的规范。

9)修正并澄清了$BYTEORD和$PnE关键字的定义。添加了$PnG关键字,描述应用于信号的线性增益。

10)荧光补偿描述的$COMP关键字替换了$DFCiTOj。

5.2附录B:国际分析细胞学学会数据文件标准委员会

Larry Seamer,主席
流式细胞仪主任
新墨西哥大学
癌症中心,细胞检测
东北萨尔路900号
Albuquerque, NM 87131
(505) 277 - 6206
lseamer@cobra.unm.edu

布鲁斯Bagwell
缅因州医学中心研究所
约翰罗伯茨路70号,8室
南波特兰,邮箱:ME 04106
75450.167 @compuserve.com

路德高岭土
计算机研究与技术主任,
12A栋2015室
美国国立卫生研究院
9000罗克维尔峰
贝塞斯达,马里兰州20892
luther_barden@nih.gov

Marc Christofferson
Becton Dickinson免疫细胞检测系统公司
2350 Qume Drive
加利福尼亚州圣何塞95131-1807
(408) 954 - 2058
(注意:: Marc Christofferson已经不在BDIS工作了。

路易斯·e·马格鲁德
临床实验室设备部
FDA /医疗器械/颂歌
盖瑟路72号
马里兰州罗克维尔20850
lem@fdadr.cdrh.fda.gov

乔治Malachowski
Cytomation公司。
马齿路东400号
Ft. Collins, CO
(303) 226 - 2200

罗伯特·f·墨菲
副教授
生物科学系和中心
光学显微镜成像与生物技术“,
卡内基梅隆大学
第五大道4400号,52号包厢
宾夕法尼亚州匹兹堡,15213
(412) 268 - 3480
墨菲+ @cmu.edu

Doug Redelman
塞拉血细胞计数
3150苏锡琳博士
雷诺,内华达州89509

加里·萨尔茨曼
生命科学部
洛斯阿拉莫斯国家实验室
邮件站M888
洛斯阿拉莫斯,NM 87545
(505) 667 - 5503
salzman@lanl.gov

詹姆斯·c·s·伍德
库尔特公司
邮件代码52-A01
南西147大道11800号
迈阿密,FL 33196-2500
电话:(305)380-2449或344-1290(语音)
(305) 344 - 5240(传真)
woodjcs@gate.net



1996年国际分析细胞学学会