# # - - - - -设置,呼应= FALSE,结果=“隐藏”,消息= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - -要求(knitr)库(BiocStyle)美元opts_chunk组(错误= FALSE,消息= FALSE,警告= FALSE) # # - - - - -读- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(zellkonverter) #获得一H5AD文件示例。example_h5ad < -系统。文件(“extdata”、“krumsiek11。h5ad”,包= " zellkonverter”) readH5AD (example_h5ad) # # - - - - -写- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -图书馆(scRNAseq) sce_zeisel < ZeiselBrainData () out_path < - tempfile(模式=“.h5ad”) writeH5AD (sce_zeisel、文件= out_path) # # - - - - -转换- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(蛇怪)库(scRNAseq)塞格尔< - SegerstolpePancreasData()往返< basiliskRun(有趣=函数(sce){#转换sce AnnData: adata <——SCE2AnnData (sce) #也许做一些工作在Python中“adata”: #等等#转换回一个南加州爱迪生公司:AnnData2SCE (adata)}, env = zellkonverterAnnDataEnv(),南加州爱迪生公司=塞格尔)# #——anndata-deps - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AnnDataDependencies () # #——anndata-deps-old - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AnnDataDependencies (version = " 0.7.6 ") # #——详细- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - readH5AD (example_h5ad verbose = TRUE) # #——verbose-set, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #这是不会运行# setZellkonverterVerbose(真正的)# # - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()