BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
DOI:
10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
这是发展BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19版本;稳定的发布版本,请参阅BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19。
完整的基因组序列智人(hg19 UCSC的版本,基于GRCh37.p13)
Bioconductor版本:发展(3.16)
完整基因组序列智人(人类)提供的UCSC (hg19,基于GRCh37.p13)并存储在Biostrings对象。
作者:Bioconductor Dev团队
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)
):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
细节
biocViews |
AnnotationData,BSgenome,遗传学,Homo_sapiens |
版本 |
3 |
许可证 |
艺术- 2.0 |
取决于 |
BSgenome(> = 1.54.0) |
进口 |
BSgenome |
链接 |
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建议 |
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SystemRequirements |
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增强了 |
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URL |
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取决于我 |
注释,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,食典委,范围,测序,tra利用,变体 |
进口我 |
appreci8R,brainflowprobes,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,cfDNAPro,ChIPComp,circRNAprofiler,decompTumor2Sig,希尔达,MADSEQ,musicatk,RareVariantVis,美国广播公司,TCGAWorkflow,trena,uncoverappLib,YAPSA |
建议我 |
AneuFinder,ATACseqQC,BadRegionFinder,Basic4Cseq,BBCAnalyzer,biovizBase,ChIPpeakAnno,chromVAR,cn,CNVfilteR,CRISPRseek,customProDB,DAMEfinder,DNAshapeR,esATAC,FDb.FANTOM4.promoters.hg19,FDb.UCSC.snp135common.hg19,FDb.UCSC.snp137common.hg19,gcapc,GenomicAlignments,GenomicFeatures,GenomicRanges,GenomicScores,GenVisR,ggbio,gmapR,GRaNIE,GUIDEseq,Gviz,h5vc,HiCDCPlus,InPAS,感兴趣,IsoformSwitchAnalyzeR,karyoploteR,maftools,MEDIPS,MesKit,MethReg,MinimumDistance,海市蜃楼,motifbreakR,motifmatchr,MutationalPatterns,ORFik,OrganismDbi,网页排名,plotgardener,plyranges,ProteoDisco,qsea,R453Plus1Toolbox,REMP,rGADEM,RiboCrypt,RiboProfiling,Rsamtools,RSVSim,rtracklayer,SGSeq,签名者,SigsPack,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP142.GRCh37,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37,StructuralVariantAnnotation,supersigs,svaNUMT,UMI4Cats,VariantAnnotation,wavClusteR,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37 |
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