BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked

这是发展BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked版本;稳定的发布版本,请参阅BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked。

亩骶蒙面基因组全序列(UCSC基因组mm10基于GRCm38.p6)

Bioconductor版本:发展(3.16)

完整基因组序列亩肌肉(鼠标)提供的UCSC的(基于GRCm38.p6基因组mm10)和存储在Biostrings对象。BSgenome.Mmusculus.UCSC序列是一样的。mm10,除了他们每个人上面具后的2:(1)装配间隙的面具(AGAPS面具),和(2)的面具intra-contig模棱两可(AMB面具)。

作者:Bioconductor Dev团队

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,BSgenome,遗传学,Mus_musculus
版本	3
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),BSgenome(> = 1.60.0),BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
进口	BSgenome,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10
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建议我	podkat,r3Cseq,的
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked_1.4.3.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked/
包下载报告	下载数据