这是发展BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9版本;稳定发布版本请参见BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.
Bioconductor版本:开发(3.16)
musculus (Mouse)的全基因组序列由UCSC提供(mm9, 2007年7月)并存储在Biostrings对象中。
作者:Bioconductor开发团队
维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者
引用(从R中,输入引用(“BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager", quiet = TRUE)) #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | AnnotationData,BSgenome,遗传学,Mus_musculus |
版本 | 1.4.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.33.5) |
进口 | BSgenome |
链接 | |
建议 | TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked |
进口我 | BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked,ChIPComp,musicatk,分裂 |
建议我 | CAGEWorkflow,circRNAprofiler,compEpiTools,EpiCompare,GRaNIE,HiCDCPlus,MEDME,methrix,MMDiff2 |
我的链接 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: