BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked

这是发展bsgenome . mmusculus . ucsc .mm9.mask;稳定版请参见BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked．

小家鼠全掩模基因组序列(UCSC版本mm9)

Bioconductor版本:开发(3.17)

musculus (Mouse)的完整基因组序列由UCSC提供(mm9, 2007年7月)并存储在Biostrings对象中。序列与BSgenome.Mmusculus.UCSC相同。mm9，除了它们每个上面都有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" bsgenomic . mmusculus . ucsc .mm9.mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，BSgenome，遗传学，Mus_musculus
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
进口	BSgenome，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
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建议
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建议我	r3Cseq
链接到我

包档案

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源包	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked/
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