SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37

这是发展snplocs . hapiens . dbsnp155 . grch37;稳定版请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37．

从dbSNP Build 155中提取的人SNP位点和等位基因，并放置在GRCh37/hg19装配上

Bioconductor版本:开发(3.17)

该包中的929,496,192个snp是从位于https://ftp.ncbi.nih.gov/snp/archive/b155/JSON/的染色体1-22、X、Y和MT的RefSNP JSON文件中提取的(这些文件由NCBI于2021年5月创建)。这些snp可以被“注入”到BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19中。

作者:Hervé Pagès

维护者:Hervé Pagès

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，遗传学，Homo_sapiens，SNPlocs
版本	0.99.24
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.2.0)，BSgenome(> = 1.67.2)
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomeInfoDb，GenomicRanges，BSgenome
链接
建议	Biostrings，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	MungeSumstats
链接到我

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37_0.99.24.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制文件(arm64)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh37/
软件包下载报告	下载数据