SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38

这是发展SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38版本;稳定的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38。

人类SNP位置和等位基因提取dbSNP建造155和放在GRCh38 / hg38组装

Bioconductor版本:发展(3.17)

这个包的949021448个snp从RefSNP JSON文件中提取染色体22页,X, Y,和山,位于https://ftp.ncbi.nih.gov/snp/archive/b155/JSON/(这些文件是由NCBI 2021年5月)。这些snp可在BSgenome.Hsapiens.NCBI“注入”。GRCh38或BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

作者:Herve页面

维护人员:< hpages.on Herve页面。github在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs
版本	0.99.24
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2.0),BSgenome(> = 1.67.2)
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome
链接
建议	Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	MungeSumstats
我的链接

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38_0.99.24.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP155.GRCh38/
包下载报告	下载数据