这是发展FieldEffectCRC的版本;对于稳定版本,请参阅fieldeffectcrc。
生物导体版本:开发(3.16)
在三种表型中的1,139个人类原代结直肠组织样品(包括肿瘤,正常邻近肿瘤和健康)的处理RNA-SEQ数据可作为Synapse.org上的Synapse ID Syn22237139获得。通过实验室可用的数据将数据解析为汇总的特性对象,以促进Dampier等人的可重复性和扩展。(PMCID:PMC7386360,PMID:32764205)。
作者:Christopher Dampier [AUT,CRE],生物导体封装维护器[CTB]
维护者:Christopher Dampier
引用(从r内,输入引用(“ fieldeffectcrc”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ fieldeffectcrc”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ fieldeffectcrc”)
html | R脚本 | 结直肠转录组的摘要份量 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | Coloncancerdata,,,,实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,homo_sapiens_data,,,,rnaseqdata,,,,reproducibleresearch,,,,序列数据,,,,组织 |
版本 | 1.7.0 |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | UTILS |
进口 | 生物使用,,,,运行,,,,总结性特征,,,,实验室(> = 0.99.6),AnnotationHub,,,,deseq2 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物基因,,,,SVA,,,,生物管理器 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/fieldeffectcrc.html |
BugReports | https://github.com/bioconductor/fieldeffectcrc/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | fieldeffectcrc_1.7.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fieldeffectcrc |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/fieldeffectcrc |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/fieldeffectcrc/ |
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