fieldeffectcrc

doi:10.18129/b9.bioc.fieldeffectcrc

这是发展FieldEffectCRC的版本;对于稳定版本,请参阅fieldeffectcrc

肿瘤,肿瘤 - 肿瘤的正常和健康的结直肠转录组作为总结性特征对象

生物导体版本:开发(3.16)

在三种表型中的1,139个人类原代结直肠组织样品(包括肿瘤,正常邻近肿瘤和健康)的处理RNA-SEQ数据可作为Synapse.org上的Synapse ID Syn22237139获得。通过实验室可用的数据将数据解析为汇总的特性对象,以促进Dampier等人的可重复性和扩展。(PMCID:PMC7386360,PMID:32764205)。

作者:Christopher Dampier [AUT,CRE],生物导体封装维护器[CTB]

维护者:Christopher Dampier

引用(从r内,输入引用(“ fieldeffectcrc”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version ='devel')biocmanager :: install(“ fieldeffectcrc”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ fieldeffectcrc”)

html R脚本 结直肠转录组的摘要份量
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 Coloncancerdata,,,,实验数据,,,,实验室,,,,表达数据,,,,homo_sapiens_data,,,,rnaseqdata,,,,reproducibleresearch,,,,序列数据,,,,组织
版本 1.7.0
执照 艺术2.0
要看 UTILS
进口 生物使用,,,,运行,,,,总结性特征,,,,实验室(> = 0.99.6),AnnotationHub,,,,deseq2
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物基因,,,,SVA,,,,生物管理器
系统要求
增强
URL //www.andersvercelli.com/packages/release/bioc/html/fieldeffectcrc.html
BugReports https://github.com/bioconductor/fieldeffectcrc/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 fieldeffectcrc_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fieldeffectcrc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/fieldeffectcrc
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/fieldeffectcrc/
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