HSMMSingleCell

DOI:10.18129 / B9.bioc.HSMMSingleCell

这是发展HSMMSingleCell版本;稳定的发布版本,请参阅HSMMSingleCell。

单细胞RNA-Seq区分人类骨骼肌成肌细胞(软件)

Bioconductor版本:发展(3.17)

骨胳肌母细胞经过分化期间良好的形态和转录变化序列。在这个实验中,主人体骨骼肌成肌细胞(软件)扩大高促分裂原条件下分化(通用),然后通过切换low-mitogen媒体(DM)。RNA-Seq图书馆从每个几百个细胞测序接管serum-induced分化的时间进程。49 - 77细胞的捕获每四个时间点(0,24、48、72小时)后血清开关使用Fluidigm C1微流体系统。从每个细胞RNA是孤立和用于构造mRNA-Seq库,然后测序深度~ 400万读/库,从而产生一个完整的每个细胞的基因表达谱。

作者:科尔杰尔

科尔维护者:科尔杰尔< broadinstitute.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“HSMMSingleCell”)

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文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,RNASeqData
版本	1.19.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10)
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包档案

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源包	HSMMSingleCell_1.19.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HSMMSingleCell
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ HSMMSingleCell
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/HSMMSingleCell/
包下载报告	下载数据