MethylSeqData

DOI:10.18129 / B9.bioc.MethylSeqData

这是发展MethylSeqData的版本;稳定发布版本请参见MethylSeqData。

公共DNA甲基化测序数据集的收集

Bioconductor版本:开发(3.16)

基础水平(即胞嘧啶水平)计数的公共亚硫酸盐序列数据集(例如，WGBS和RRBS)的集合，提供作为summarizedexperation对象与样本和基础水平元数据。

作者:彼得·希基[aut, cre]

维护者:彼得·希基<彼得。希基在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化biocdevel的使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("MethylSeqData")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“MethylSeqData”)

超文本标记语言	R脚本	用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData，ExperimentHub，Homo_sapiens_Data，MethylSeqData，Mus_musculus_Data，SequencingData
版本	1.7.0
许可证	CC0
取决于	SummarizedExperiment
进口	ExperimentHub，HDF5Array，rhdf5，GenomeInfoDb，S4Vectors，GenomicRanges统计数据,IRanges,跑龙套
链接
建议	BiocFileCache，BiocStyle，data.table，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	MethylSeqData_1.7.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/MethylSeqData
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/MethylSeqData
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MethylSeqData/
软件包下载报告	下载数据